经常吃微波食品的人或动物，体内会发生严重的生理变化。以微波炉烹煮或加热食物，会破坏食物营养，使到食物的营养大大减少，因为电磁波辐射改变和破坏了食物的分子结构。
微波炉加热食物的同时会使食物的分子结构发生改变，产生人体不能识别的分子，其中有些具有毒性，还可能致癌。肉类、奶类、谷物、水果和蔬菜经微波炉加热后都可能产生引起癌症的化学物，因而平时应尽量少食用微波炉加热的食物。
只要正确使用微波炉，加热食物有毒就不会对人体产生危害。家用微波炉微波的频率是2450兆赫，这种微波不能透入人体伤害内部的器官和组织，只能使皮肤和体表组织发热而已，只要不是持续长时间地辐射，一般不会对健康构成危害。
微波炉对孩子孕妇还是有一定影响的，在热饭的时候，还是离得远一些，这样对胎儿有一定的保护作用。微波炉对孕妇是有辐射的，但是短时间接触影响较小不必过于担心。定期产检，多注意休息，多吃蔬菜水果。
有危害但是很小，微波炉的电磁辐射的确要比普通的小家电或者大家电的电磁辐射高，由于微波炉工作原理本身就是利用电磁波，难免会有电磁辐射产生。但是要说这些电磁辐射会对人体造成很大伤害，导致癌变，或者损伤之类的，确实小题大做。
使用微波炉不会致癌。微波炉加热是物理加热，原理是使食物分子剧烈运动摩擦产生的热来加热食物的，不会改变食物的性质，自然就不会致癌物产生。微波是一种电磁波，跟收音机、电报所用的电波、红外线以及可见光本质上是同样的东西。
