常见的副作用表现为抗胆碱能作用，例如可引起口干、便秘、排尿困难。有些可以表现为头痛、头晕，嗜睡。或者出现心悸、心前区不适等。双相障碍抑郁，长期服用舍曲林，可以诱发躁狂发作。
服用舍曲林后失眠是正常现象，因为舍曲林的不良反应，关于精神方面，患者容易失眠。神经系统不良反应可表现为头晕、嗜睡或四肢震颤。
如果患者刚服用舍曲林，失眠是正常的。建议患者继续口服舍曲林抗焦虑抗抑郁。当患者的药效稳定后，患者的失眠会得到明显的改善，因为舍曲林可以改善患者的焦虑和抑郁情绪，睡眠状况也会得到改善。所以刚吃的时候失眠很正常，不用太担心。但不建议服用后突然停药，必须逐渐减量，并根据医生调整药物的剂量。
盐酸舍曲林片主要的药理作用就是有抗抑郁作用，同时可以针对抑郁症伴有的焦虑等症状，有一定缓解作用，它的主要的作用原理就是选择性五羟色胺的再摄取进行抑制，盐酸舍曲林片如果长期服用或者是大剂量应用的话，肯定会出现一些副作用，主要的副作用，包括胃肠道，以及嗜睡等作用。
一般来说，盐酸舍曲林作为选择性5-羟色胺再摄取抑制剂，副作用较少。
目前常见的副作用主要是服药初期的胃肠道反应，如口干、口苦、恶心、呕吐、便秘、腹泻等。这些症状可以在服药后一周左右消失。还有其他副作用，如头晕或头痛，以及过度兴奋甚至焦虑，如果严重的话，也可能导致躁狂的风险。
对于男性患者，舍曲林的副作用可能导致射精延迟。如果长期服药，肝肾功能可能受损。
长期服用舍曲林，突然停药就会出现综合征，如出现失眠、焦虑、心慌乏力、大量出汗、坐立不安以及抑郁和焦虑病情的加重等。患者可以逐渐减少，到医院咨询患者医生，停药两周之后所有的副作用就会消失。
盐酸舍曲林片不良反应有胃肠道不适，例如恶心、呕吐、腹泻、厌食，也会出现头痛、头晕、疲乏无力、嗜睡以及失眠等不良反应。另外，它还可以出现过敏性皮疹以及性功能减退等少见不良反应。
