乙肝病毒携带者如果出现了反复的肝脏功能不正常，而且肝脏的形态结构是正常的，那么如果是乙肝大三阳身体的病毒量超过了2×10的五次方，如果是乙肝小三阳身体的乙肝病毒量超过了2×10的四次方，这就有抗乙肝病毒治疗的指征，针对年轻的病患需要积极地选择干扰素抗病毒治疗。
现在全世界都没有战胜过乙型肝炎，也没有能够根除乙型肝炎的新药，因此也无法根除。
乙型肝炎的治疗方法是保肝、护肝、抗病毒，因此，乙肝病人要进行肝功能检查，包括两对半、乙肝DNA和肝彩超，一旦有肝的异常，或是有明显的疲倦、厌油感、胃胀感等症状，应给予护肝、抗病毒的药物，一旦达到了抗菌指标，必须进行抗病毒，从而控制住了病毒的扩散，从而防止肝脏损伤和肝硬化。
乙肝存在一个慢性化过程，乙肝痊愈通常在急性感染期。
乙肝急性感染的时间不得超过半年，是急性感染期，这时阴转率可达60%-80%，因此应在这段时间内进行积极治疗。如果一个月后乙肝病毒还是（+），则提示可在短期内使用干扰素，有助于乙肝的完全阴转。
乙肝一旦感染半年以上，乙肝的根治难度更大，目前尚无彻底消除乙肝特效药物，建议积极配合医生治疗。
在乙肝治愈方面，目前还很困难，多数人都达不到治愈乙肝的目的。
少数人满足干扰素治疗指征，是可能达到乙肝表面抗原转阴和乙肝DNA转阴的，乙肝功能正常，即临床治愈之谓。由于这种病毒携带着人体免疫系统中一些免疫细胞，所以很容易引起各种病毒性肝病，包括甲型肝炎、乙型脑炎等。鉴于乙肝表面抗原的定量相对较少，病毒水平相对较低，肝脏在形态结构上无任何问题，肝功能轻微，中度异常者，这部分人可考虑干扰素抗病毒治疗，主动干扰素抗病毒治疗则，鉴于这一部分的确可能达到乙肝表面抗原转阴，乙肝病毒携带者或乙肝患者必须进行个体化治疗。
慢性乙型病毒性肝炎患者抗病毒治疗时，一般建议患者不要自行停药，要经过专科医生的指导才能停药。
临床上有很多病人擅自停药，导致肝炎复发，甚至出现重症肝炎。乙型病毒性肝炎患者抗病毒治疗多久可以停药，一般需要三到五年的时间，主要是根据乙肝病毒载量的多少来决定是否要停药。如果发现乙肝大三阳到小三阳，乙肝病毒会一直转阴，需要观察一段时间才能确定是否可以停药或者通过抗病毒治疗。患者达到乙肝表面抗原转阴，甚至出现乙肝抗体，如果病毒为阴性，可以考虑停药，但这种情况非常罕见，所以大多数乙肝患者不能停药，甚至终身服药，停药标准非常严格，必须在医生的指导下进行。