慢性乙型肝炎（CHB）治疗关键是抗病毒治疗。抗病毒治疗主要目标是阻止进展性肝病尤其是肝硬化和肝衰竭的形成，阻止肝细胞癌（HCC）的发生，从而阻止死亡。临床上的治疗终点即通过治疗达到肝功能恢复正常，外周血乙肝病毒基本消失、HBV-DNA持续6个月处于低复制状态、临床症状消息、不影响日常生活、学习和工作。
慢性乙型肝炎至今为止，还没有任何一种药物或治疗方法能够很有把握的实现乙肝表面抗原的阴转或血清学转换。还有一部分病人在经历了漫长的疾病进程，甚至于病情已经发展到肝硬化、肝癌阶段，自发的实现了表面抗原的阴转或血清学转换（HBsAg→HBsAb），但此时病情已接近或达到终末期，从病毒清除中所获得的收益已经微乎其微。
现在就没有可靠的药物能治疗乙肝，而药物治疗一般需要终身用药。要注意合理保养休息，不要劳累，保持心情舒畅，不要吃那些辛辣刺激性的食物，多吃蔬菜水果，多吃高蛋白，高维生素的食物。
乙肝病人的治疗，一个是提高自身免疫力，提高机体抗病毒的能力，当转氨酶大于80或持续肝功异常、肝硬化的时候说明自己免疫机制启动，这时候用抗病毒药效果比较好。到正规医院做系统检查，由专家指导用药。另外平时要注意饮食，忌酒，忌食辛辣，注意不要过度劳累和熬夜，保持好心情，加强锻炼。
慢性乙型肝炎就是乙肝病毒在人体内感染后会反复引起肝脏炎症损害发生，当炎症损害发生时，通常会发生肝功能异常。若肝功能重复发生异常后可能会引起肝硬化和肝癌。中度慢性乙型肝炎，说明肝功能已出现明显异常。这类病例需积极治疗，但治疗所需时间长短，这就因个体而异了。
慢性乙型肝炎的治疗中，最为重要的是抗病毒治疗，唯有病毒得到控制，肝脏炎症损害才会得到改善。除抗病毒治疗外，还可辅以护肝、降酶的对症治疗。
若在治疗后，慢性乙型肝炎病人的HB-VDNA转阴，而其肝功能亦恢复正常，此种情况表示为治疗已处于较佳状态，但能否停药还要看情况。
慢性乙型肝炎的治疗目标一般是抑制病毒的复制，积极的控制病情。
需要对慢性乙型病毒性肝炎进行积极有效地抗病毒药物治疗，如果有慢性活动性肝炎或肝硬化则应长期随访观察并进行肝功能评估。如果是抗病毒治疗效果不佳或不完全的话就会影响到肝功能恢复以及慢性肝炎的发展甚至肝硬化。因此，必须针对个体情况，选择适当治疗方案。在抗病毒过程中必须注意观察肝功能变化，如果出现了异常就要及时进行对症处理。