瘘口、瘘管增加：肛瘘的多次反复发作，脓液可穿破管壁顺括约肌间隙蔓延而成多发性、复杂性肛瘘，不但给治疗带来困难，而且也影响到肛门的生理功能。肛瘘感染发炎后，肛门疼痛剧烈，溃破后脓水污染内裤，脓汁刺激局部皮肤，肛门瘙痒剧烈。久而久之可使身体虚弱消瘦，精神不振，抗病能力下降，发作亦越频繁，形成互为因果。
肛瘘不治有可能会出现疼痛、破溃、流脓等现象。引起肛门潮湿、瘙痒等症状，严重的有可能会引起肛门发炎，导致大便失禁，也会引起肛门狭窄，影响到正常的生活，肛瘘大多是因为上火大便干燥引起的，平时可以多吃一些富含膳食纤维的食物，肛瘘严重者可以在医生的指导下使用抗生素药物来治疗，严重者可能需要通过手术治疗，平时要少吃辛辣刺激食物。
肛瘘典型的一些症状就是肛门流脓、流血，瘙痒，有的还伴有异味。肛瘘久拖不治，瘘口会增加，治疗难度也会增大，十年以上肛瘘具有一定癌变风险。积极手术治疗，是可以治好的。
由于反复发作，脓液可穿透管壁，沿括约肌间隙扩散，形成多发复杂的肛瘘，不仅给治疗带来困难，而且影响肛门的正常生理功能。任由肛瘘发展，可对括约肌造成严重损伤，甚至可能造成肛门失禁等并发症。
肛瘘严重了会感染。肛瘘是常见的肛门疾病。祖国医学称为痔漏。是肛管、直肠周围脓肿溃破切开后的后遗症。肛瘘大多是非特异性感染，少数是结核性的。肛瘘是不会或很少有可能自然治好的。