公司体检都检查乙肝。公司入职体检包括内科检查如身高、体重、血压、心肺的听诊及腹部的触诊等。外科检查包括脊柱、四肢关节、皮肤及淋巴结等，还有一些检查包括听力及视力等。
公司体检没有乙肝五项。目前国家规定除一些特殊职业，取消入学、就业体检中的乙肝五项检查，但是一些大型企业还是要求员工做一下乙肝五项检查。乙肝五项主要检测人们有无乙肝病毒感染。
乙肝患者入职时有些公司是需要进行肝功能检查的，有些公司不需要检查肝功能，这还有可能跟公司的行业有关。因为有些职业目前乙肝患者还是不能从事的，像餐饮业、医药行业、食品加工等行业，乙肝患者还是不能从事的。所以入职是否体检肝功能还要看公司的性质以及公司的规定。
查甲肝需要抽血，检查甲肝抗体IgM，甲肝抗体IgM结果是阴性就表示正常，是阳性的就需要考虑甲肝病毒感染。查乙肝也需要抽血，检查乙肝五项，阴性的就是正常的，阳性的就说明感染了乙肝病毒。
检查肝功能并不能够明确是否存在乙肝。肝功能检查以后会出现转氨酶、胆红素等相关指标的升高或者异常，由于临床上引起指标异常的原因很多，单凭肝功能检查还不能够确定具体的疾病，乙肝的诊断主要是通过乙肝五项。
一般入职体检是不会检查乙肝的，这是有国家规定的，并且国家经经明令禁止用人单位（除军队、武警、公安特警外）和体检机构在体检中要求检查两对半项目（即乙肝五项），也不得要求提供乙肝项目检测报告，也不得询问是否为乙肝表面抗原携带者，只要求肝功能正常即可。