可以通过接种疫苗的方式预防新生儿乙肝。
母亲若患有乙型肝炎，在新生儿出生后立即打乙型肝炎疫苗，并在第一时间内给予有效价免疫球蛋白，可以提高阻滞的成功率，预防乙肝。在孩子出生之后，如果妈妈没有乙肝，那么就只是一种简单的乙型肝炎的阻断，只需接种疫苗，一般就可以预防乙肝了。之后要定期进行乙肝抗体测试，打三次乙型肝炎疫苗，直至出现抗体。
母亲乙肝阳性应该通过以下方式来预防新生儿感染：
第一，在生产的三个月内，每个月三次肌注射乙肝免疫球蛋白体，如果乙肝阳性而且有乳头破损不宜哺乳和新生儿免疫接种。
第二，可以在新生儿出生后通过接种疫苗来中和体内的病毒。
第三，如果是乙肝抗体和e抗体呈阳性者，那么这一类型的新生儿在出生后要尽快进行乙型肝炎的免疫，在12个小时以内、一个月和半年中分别进行一次免疫，每隔三到五年就要进行一次强化。
可通过注射乙肝疫苗给新生儿预防乙肝。
通常情况下，宝宝出生后12个小时之内就可以注射乙肝疫苗。如果是乙肝患者，不仅要打乙肝疫苗，还要打HBV高效价免疫球蛋白，一般情况下，大部分的乙肝孕妇都可以避免感染，而乙肝疫苗是最好的预防手段，因为乙肝疫苗的普及，导致儿童感染的几率很小，而随着乙肝疫苗的普及，新的感染病例也会越来越少。
新生儿接种乙肝疫苗需要在第一天接种第一针，第二针在30天内打第二针，180天打第三针。
现在普遍认为三次乙肝疫苗能够促进人体的免疫，从而降低乙肝病毒的感染几率，降低母亲的垂直传播的危险。不过，接种了乙型肝炎疫苗并不意味着就能得到保护的抗体，而保护性抗体的生成与自身的免疫力有关，因此需要在一周岁左右做一次血液检测，检测到乙肝两对半，以确定是否得到了保护的抗体，如果乙肝表面抗体为阴性则需要进一步接种。
通常是婴儿8个月时，也可到医院进行乙肝检查。
如果宝宝妈妈是乙肝患者，想明确宝宝有没有经母婴传播乙型肝炎，可以在宝宝出生后立即抽血查乙肝抗原和抗体，并且注射乙肝免疫球蛋白和乙肝疫苗。通常是婴儿8个月时也可进行乙肝五项的检查，因为这个时候宝宝身体里就出现了乙肝抗体。如果出现了乙型肝炎，则说明已经感染到了病毒。如有异常，及早治疗。若是夫妻双方有乙肝病毒，应等待机体恢复正常，才会开始备孕。
新生儿出生24小时内接种乙肝疫苗，常规的乙肝疫苗注射是016方案。
新生儿在出生24小时之内，要及时的接种第1针乙肝疫苗。如果出生24小时之后这种乙肝疫苗会影响到疫苗的预防效果。一个月和六个月的时候分别再注射后面的两针。若母亲是乙肝感染者，出生婴幼儿是低产儿、低体重儿在出生后更要加强一针，需分别在0、1、2、6个月注射乙肝疫苗。
