长期服用的后果会直接影响肝、肾、脑等功能。而且氯氮平片的副作用是，镇静作用强和抗胆碱能不良反应较多，常见有头晕、无力、嗜睡、多汗、流涎、恶心、呕吐、口干、便秘、体位性低血压、心动过速。
长期服用氯氮平副作用会有头昏、乏力、嗜睡、多汗、流涎、恶心、呕吐、口干、便秘还有体位性低血压、心动过速的现象出现。氯氮平来治疗精神分裂症，对于精神分裂症的阳性症状和阴性症状都非常有效。
轻微精神分裂症，有明显的精神病性症状，包括幻觉、妄想、兴奋、激越、躁闹甚至是攻击行为，还有可能具有阴性症状，比如情感淡漠、意志缺乏、思维贫乏，可能还会有思维联想的障碍，比如思维松散、思维破裂，还有思维被播散、思维被洞悉、强制性思维等。
氯氮平想要成功停药，需要在患者巩固治疗期间病情稳定、自知力大部分恢复、社会功能受损不明显等情况下进行。氯氮平一般用于反复发作或者对其他抗精神病药物反应差的患者，停药需谨慎。
服氯氮平后多数病人有便秘症状，可辅助通便类药物缓解。还有可能白细胞下降，属于较危险的副作用，建议定期检查血常规，观察病人白细胞是否有异常。若白细胞数量轻微下降，可服用增加白细胞类的药物。
