艾滋病病毒急性期症状比较典型，主要表现为流感样的症状，可以发生在高危接触两周以内。临床症状上主要表现出咳嗽咳痰，流鼻涕，鼻塞，咽痛，全身乏力，肌肉酸痛，有的患者还会出现一过性的淋巴结肿大，身上长皮疹，腹泻和便秘交替等症状。
大部分病人在艾滋病病毒感染后，由于病毒在体内大量复制，免疫系统对抗艾滋病病毒导致部分感染者出现病毒血症和免疫系统急性损伤，引起艾滋病急性感染期临床症状。大部分病人在感染艾滋病病毒后2到4周后出现发热、皮疹、腹泻淋巴结肿大等急性期症状，个别输血感染者急性期发作可提前到接触病毒一周后出现症状。
艾滋感冒和普通感冒的症状都差不多，都会发生头痛脑热，头晕，咳嗽流鼻涕等症状，普通感冒症状较轻，而艾滋病在急性期可表现多种症状如发热多为高热，头痛，全身酸痛，大汗，腹泻呕吐，淋巴结肿大，皮肤有斑疹等，普通感冒一个星期左右就会好，但是艾滋感冒病人免疫力下降，会出现较长时间或者几个月甚至经久不好。
皮肤粘膜是艾滋病侵袭的主要部位之一，全身症状包括发热、咽痛、盗汗、关节痛、淋巴结肿大和肝脾肿大，在神经系统的损伤中约9%的可能出现急性HIV脑膜炎，临床表现为发热、头痛、呕吐及脑膜刺激征。
不同的个体窗口期时间并不相同，从2周至3个月不等，有的感染者高危行为后满2周就可以检测出抗体，而个别的感染者直到满3个月后才可以检测出抗体，也就是说在窗口期是无法判断机体是否感染了艾滋病病毒，所以是无需治疗的。
急性感染性腹泻可以通过服用补液和静脉补液来缓解不适。
患者治疗后四个小时可以开始进食，但要少吃多餐，少吃油腻食物，吃易消化、富含维生素及纤维素的食物。对于急性感染性腹泻，除了可以通过口服补液、补液等方法进行治疗，还可以选用蒙脱石散等具有保护肠粘膜和吸收肠道中的毒素的药物。另外，益生菌能治疗痢疾，有益于人体的肠道健康。
