如果肝脏疼痛是由于多囊肝导致的，特别是肝脏的囊肿导致肝脏损伤引起的。就需要考虑给予手术治疗。需要检查肝脏囊肿的情况和肝脏功能，判断肝脏有没有损伤，如果有明显损伤，需要及时的给予保肝治疗和手术治疗改善。
多囊肝、多囊肾，治疗上主要以对症治疗为主，比如多囊肝、多囊肾的患者，如果出现了血尿，患者早期卧床休息，合并感染积极的抗感染治疗。如果囊肿过于巨大，而产生了压迫的症状，比如多囊肾出现腰部的疼痛，肝囊肿出现上腹部的疼痛，这时如果有单个的囊肿比较巨大，可以行去顶减压术，来减轻患者的这种疼痛不适。出现了肝功能的异常或者肾功能衰竭，对症的使用保肝类的药物、保肾降糖类的药物对症治疗。
多囊肾多囊肝饮食上要少吃油脂过多的东西，饮食宜清淡，饮食应富含足够的营养，纠正偏食及不正常的饮食习惯，不宜常食刺激性、海产品等，要及时就医，做相关的检查，确定囊肿的大小决定治疗措施。
肝内多发囊肿并不算一种很严重的疾病，因为肝内多发囊肿，它是肝脏的一种良性病变，还会合并其他脏器的囊肿，比如常见的多囊肾，这种囊肿一般都是先天存在的，大多数是多个状态存在，囊肿的边界比较清晰，而且内储存的囊液不宜被发现。往往是在进行体检的时候，经过B超才发现的。
通常情况下，有多囊肝不一定就会有多囊肾。具体分析如下：
多囊肝是一种罕见的遗传性疾病，可以作为孤立性多囊肝病独立存在，也可以作为常染色体显性遗传性多囊肾病的伴随症状。多囊肾是一种先天性的发育畸形，表现为双侧的肾脏产生多发的肾脏囊肿，可有几十个或上百个呈葡萄串样结构。并不是所有的多囊肝患者都合并多囊肾，只是说多囊肝的患者同时合并有多囊肾，这种疾病的概率相对会比较高。
