一般来说，盐酸舍曲林作为选择性5-羟色胺再摄取抑制剂，副作用较少。
目前常见的副作用主要是服药初期的胃肠道反应，如口干、口苦、恶心、呕吐、便秘、腹泻等。这些症状可以在服药后一周左右消失。还有其他副作用，如头晕或头痛，以及过度兴奋甚至焦虑，如果严重的话，也可能导致躁狂的风险。
对于男性患者，舍曲林的副作用可能导致射精延迟。如果长期服药，肝肾功能可能受损。
盐酸舍曲林片是一种新型的抗抑郁药，也称之为选择性五羟色胺再摄取抑制剂，能够有效改善抑郁情绪，也有一定的抗焦虑作用，临床上主要用于医治各种类型的抑郁症。其常见的副作用表现为抗胆碱能作用，例如可引起口干、便秘、排尿困难。有些可以表现为头痛、头晕，嗜睡。或者出现心悸、心前区不适等。双相障碍抑郁患者，长期服用舍曲林，可以诱发躁狂发作。副作用两三天就可以逐渐消退。
盐酸舍曲林片不良反应有胃肠道不适，例如恶心、呕吐、腹泻、厌食，也会出现头痛、头晕、疲乏无力、嗜睡以及失眠等不良反应。另外，它还可以出现过敏性皮疹以及性功能减退等少见不良反应。
长期服用，会对肝肾功能还有精神方面有一定的影响，但是，综合利弊，服药的作用会更大一些，建议应该遵医嘱使用药物控制病情，这才是比较好的方法建议平常饮食作息合理，可以放松心情，定期去医院进行复诊。
常见的副作用表现为抗胆碱能作用，例如可引起口干、便秘、排尿困难。有些可以表现为头痛、头晕，嗜睡。或者出现心悸、心前区不适等。双相障碍抑郁患者，长期服用，可以诱发躁狂发作。
此药物是比较常见的新型抗抑郁剂，能够有效改善抑郁情绪，也有一定的抗焦虑作用。在临床上主要用于治疗各种类型的抑郁症，或着是某些类型的神经症，例如恐惧症、强迫症，躯体形式障碍等，也用于治疗伴有焦虑抑郁情绪的其他精神障碍或者躯体疾病等。