肾结石可以通过体格检查和影像学检查确诊。尿液常规检查，观察是否有尿糖、尿蛋白、红细胞、白细胞等，判断是否合并尿路感染及糖尿病等；血常规检查，如白细胞的数目增多，则可能存在感染。
如果结石较小通过多喝水多运动就可以逐渐自行排出体外，如果结石较大，需要去医院进行体外碎石或者是采取手术治疗，进行检查需要空腹检查的，不然吃食物容易导致肠道胀气，影响检查结果。
首先选择无创的检查。临床上泌尿系的B超。把肾、输尿管、膀胱乃至于尿道能够用B超来看一下，了解结石有多大，在什么部位，会出现什么样的不良的后果。第二个检查就是x线的检查。也就是说常常拍的叫腹平片，通过腹平片能够看到结石的部位、结石的形态，结石是否在肾脏里面，另外通过腹平片上结石密度来结石的成分。
肾结石的检查大多数是依赖于影像学的检查如X线检查，X线检查是诊断尿路结石最重要的方法包括尿路平片、排泄性尿路造影、逆行肾盂造影、经皮肾穿刺造影等。可能是B超检查，可对肾内和无结石及有无其他合并病变作出诊断，确定有无肾脏积水，尤其能发现X线透光的结石，还能对结石造成的肾损害和某些结石的病因提供一定的证据。CT检查是目前结石诊断的首选。
通常来说，无法比较肾结石检查CT好还是B超好，它们各有优缺点。
肾结石是指晶体物质（如钙，草酸盐，尿酸盐等）从尿液中析出并沉积于肾脏，属于上尿路结石，发病可能与代谢异常、生活方式等多种因素有关，可以进行CT或者B超，如果已经确诊存在有肾脏结石，需要进一步手术，建议选择CT检查，可以了解结石的大小、位置与周围组织的关系，方便设计手术入路；如果不确定是不是肾结石，选择B超，B超价格低廉，能够观察到肾脏内3mm以上的结石，分辨率也比较高。
通常来说，诊断胆结石需要做腹部CT检查、B超检查、核磁共振检查等检查。
胆结石包括胆囊和胆管的任何部位发生结石的疾病。按发生的部位来分，可分为胆囊结石、肝外胆管结石和肝内胆管结石或者上述多部位同时并发，其中胆囊结石占全部结石的50%左右。胆石病的临床表现以右上腹胆性绞痛、黄疸和发热为三大主证，其疼痛往往于夜间、饱餐后或进食高脂肪食物后发作，疼痛可向右肩或右肩胛部放射。通常可以进行腹部CT检查、B超检查、核磁共振检查等检查。
