通常来说，无法比较肾结石检查CT好还是B超好，它们各有优缺点。
肾结石是指晶体物质（如钙，草酸盐，尿酸盐等）从尿液中析出并沉积于肾脏，属于上尿路结石，发病可能与代谢异常、生活方式等多种因素有关，可以进行CT或者B超，如果已经确诊存在有肾脏结石，需要进一步手术，建议选择CT检查，可以了解结石的大小、位置与周围组织的关系，方便设计手术入路；如果不确定是不是肾结石，选择B超，B超价格低廉，能够观察到肾脏内3mm以上的结石，分辨率也比较高。
肾结石检查尿常规、泌尿系彩超或者泌尿系CT等项目。
肾结石是指生长在肾盂和肾盏的结石。造成肾结石原因的很多，常见的有全身代谢性因素、尿路局部性因素、环境和饮食因素等。肾结石为泌尿外科的常见病和多发病，在泌尿外科中占有相当大的比重。临床上常见有肾绞痛，血尿等症状表现，严重影响患者生活质量。出现肾结石通常需尿常规检查，泌尿系彩超或泌尿系CT检查，开展诊断和鉴别诊断。目前临床上常用手术方法来取出结石。
通常情况下，查肾结石CT需要检查膀胱CT。具体情况分析如下：
肾结石是草酸钙等晶体物质在肾脏异常聚集所致，患者一般会出现腰痛、血尿、尿急、尿痛等症状，患者可能在做检查的时候，发现结石已经进入了膀胱，因此患者需要检查膀胱CT，以便明确的判断出结石的位置，结石的大小，结石的数目。
肾结石患者可按照医嘱使用排石颗粒、肾石通颗粒、尿石通丸等药物进行治疗。
肾结石的检查大多数是依赖于影像学的检查如X线检查，X线检查是诊断尿路结石最重要的方法包括尿路平片、排泄性尿路造影、逆行肾盂造影、经皮肾穿刺造影等。可能是B超检查，可对肾内和无结石及有无其他合并病变作出诊断，确定有无肾脏积水，尤其能发现X线透光的结石，还能对结石造成的肾损害和某些结石的病因提供一定的证据。CT检查是目前结石诊断的首选。
肾结石可以通过体格检查和影像学检查确诊。体格检查即肋腰点在第12肋下缘与腰大肌外缘叩痛明显，提示可能存在肾结石。确诊是通过泌尿系彩超、腹部立位平片或者泌尿系CT检查来确诊。
肾脏结石不能通过体检来确定病因，一般通过临床表现和病历来判断，但要确保诊断的准确，还需要通过化验、放射科等方法来确定。
尿常规检查主要是以肉眼或镜下的血尿为主，但在感染的时候会出现脓尿，也可能会出现结晶尿，即尿液中含有微小的粒子，如果是感染型的，尿中会出现大量的尿，如果病人的尿道结石与代谢情况有一定的关系，需要进行新陈代谢检测，24小时后再进行尿等。对泌尿系统的超声、CT等疾病进行影像学检查是目前最常用的方法。