输尿管结石伴有肾积水，提示已出现梗阻性肾病，建议积极排石治疗，尽早解除梗阻。根据结石的大小，可以采取内科治疗和外科治疗。如果结石直径小于0.6cm，一般通过应用解痉的药物，比如654-2，钙离子拮抗剂，多饮水，多运动可以排除体外。如果结石超过0.8cm，就要采取外科治疗，比如体外震波碎石，或者是输尿管镜，或者是开放手术治疗。
如果结石大于0.5厘米小于1.2厘米，结石嵌顿的时间不长，肾积水不严重，可以考虑体外震波碎石。如果结石在输尿管下段，怀疑有肉芽组织包裹，建议行输尿管镜钬激光碎石。如果结石在输尿管上段，可以考虑输尿管软镜或者经皮肾镜手术。
需要口服一些药物来进行治疗，因为输尿管结石引起的尿血主要是由于输尿管结石与输尿管黏膜发生摩擦，从而导致输尿管黏膜的小血管破裂出血，从而导致病人尿血。
输尿管结石术后疼痛与是否放置引流管、结石残留、输尿管痉挛有关，术后常见的临床表现为尿频、下腹部不适、血尿，可以使用α受体阻滞剂进行解痉治疗，缓解平滑肌的收缩。部分残留较小的结石，排石过程中也会出现疼痛，需注意是否造成石阶，可通过重置尿管或二次碎石等方式进行缓解，尤其操作部位水肿常导致腰部疼痛，建议放置输尿管导管解决肾积水。
可以保守治疗和微创手术治疗，解除病痛，保护肾脏功能，防止结石复发，输尿管结石是最常见的上尿路结石，多发生于中壮年，男性多发，在泌尿系结石中，大约20%位于输尿管，其中70%位于输尿管下段。
如果是输尿管结石引起梗阻，则可以进行排石治疗或者手术取石。如果是输尿管肿瘤，则需要进行手术治疗，炎症需要进行抗菌消炎治疗。输尿管狭窄可进行扩张或者输尿管支架植入，行球囊扩张以及手术治疗。
