肠结核狭窄，腹痛可给予抗胆碱药或其他解痉药。伴有不完全性肠梗阻者，给予胃肠减压以减轻梗阻近端肠管的扩张与潜留。完全性肠梗阻，肠道大量出血经积极内科治疗仍未能满意止血者需要手术治疗。
要积极配合医生治疗，首先要消除症状，强调早期治疗早期病变是可逆的改善全身症状，可以促进病灶愈合。可以采用抗结核药物治疗，同时多注意休息，可以增强自身体质或者抵抗力，多吃新鲜水果蔬菜等。
肠结核阳性尽快去传染病医院进行抗结核治疗的。感染的可能性也相对较高。仍然需要隔离治疗。肠结核为消化系统结核中最常见者。绝大多数继发于肠外结核病，特别是空洞型肺结核。
肠结核腹泻可以选择抗结核药物以及止泻药物治疗。
在早期发现应该积极配合医生进行合理规范使用抗结核药物治疗，规律用药才可以看到效果，不可以中途停药或者是私自加量减量，在用药治疗期间定期进行监测，看一下病情是否得到缓解。腹泻症状严重患者，可以选择止泻药物进行综合处理，可以做到双管齐下，治疗效果是非常好的。
日常生活中应该多注意休息，保证充足睡眠，尽量避免干重体力劳动，也应该避免吃油炸烧烤类食品，还应该大量饮水，避免出现脱水。
指导意见：肠结核的治疗目的是消除症状、改善全身情况、促进病灶愈合及防止并发症，强调早期治疗，注意增加营养，增强体质，规律全程服用合适的抗痨药物， 出现手术指证的需要考虑进行手术治疗。
肠结核的治疗与肺结核一样，均应强调早期、联合、适量及全程用药。 一、休息与营养 合理的休息与营养应作为治疗结核的基础。活动性肠结核应强调卧床休息，减少热量消耗，改善营养，增加机体抗病能力。 二、抗结核药物治疗 抗结核药物选择、用法详见肺结核。一般可分长疗程法与短疗程法： (一)长疗程法 此系标准疗法，用异菸肼、链霉素两药或加对氨基水扬酸三药联合应用。全程需12-18个月。 (二)短疗程法 疗程缩短至6-9个月其疗效与复发率和长疗程法取得同样满意效果。一般用异菸肼和利福平二种杀菌剂联合，对严重肠结核或伴有严重肠外结核者，宜加链霉素或吡嗪酰胺或乙胺丁醇三药联合。此种短疗程法需注意药物对肝脏的损害。可用利福啶代替利福平，每日150mg，毒性似较利福平为低。 三、对症处理和手术治疗 腹痛可用颠茄、阿托品或其它抗胆碱药物。不完全性肠梗阻有时需行胃肠减压，并纠正水、电解质紊乱。有贫血及维生素缺乏症表现者，对症用药。 手术治疗主要限于完全性肠梗阻，或部分性肠梗阻经内科治疗未见好转者，急性肠穿孔引起粪瘘经保守治疗未见改善者;大量肠道出血经积极抢救未能止血者。 肠结核常继发于肺结核，故应对原发病诊断，积极治疗，加强公共卫生宣传，教育患者避免吞咽痰液及不随地吐痰，牛奶应充分消毒。
