传染性软疣部分患者不治疗也有可能会自愈。
传染性软疣是因病毒感染引起的，大多有自限性，但自愈时间较长。传染性软疣具有较强的传染性，可自体接种传染，由一个传染到多个，疣体也会逐渐增多，因此，发生传染性软疣，应积极治疗。建议患者及时就医治疗，以免疣体蔓延，增加治疗难度。
传染性软疣的治疗不难根治。
传染性软疣是由于感染传染性软疣病毒而引起的病毒性疾病，临床直接行疣体夹除术，是较为行之有效的方法之一。有些病人若软疣较严重，还可使用激光、用冷冻处理。部分病人还可联合使用外涂之药，例如维A酸软膏、咪喹莫特乳膏等，但仅用外涂药物疗效相对较差。
女性患上传染性软疣使用涂抹药物一般可以治好，但是单纯只用外用药不是最好的治疗方式。
传染性软疣可通过外用3%酞丁胺软膏或西多福韦软膏等外用药物进行治疗。为了能将药效发挥到最好的效果，建议在涂抹药物之前最好用刮疣器将皮损部位的软疣先进行刮除。在刮除软疣小体后可用碘酒进行止血消毒，再使用涂抹药膏会有更好的效果。
女性传染性软疣涂药膏能好，需要积极遵医嘱用药。
传染性软疣的治疗通常无需全身给药，常用的局部药物为维A酸软膏和斑蝥素，提示应在医师指导下进行规范使用。在治疗期间女性要做好局部的皮肤护理，避免局部的外伤或者过敏后搔抓刺激皮肤，以免影响身体恢复。
一般传染性软疣病人经积极治疗后，能够治愈。
传染性软疣可由传染性软疣病毒感染引起，还可能由于经常和别人密切接触，而导致交叉感染现象。可采用物理治疗来治疗，如电灼法、冷冻法，从某种程度上减轻了病情。
若疾病程度较严重，亦可在手术后用软膏处理，例如咪喹莫特乳膏、莫匹罗星软膏等，能有效改善疾病。
如果患者前往不正规的医院就诊，可能误诊率比较高。
传染性软疣具有一定危害，因为传染性软疣是一种传染性皮肤病，但只要患者及早治疗，且治疗方法得当，就能大幅降低传染性软疣危害。建议患者前往正规的医院，一般不会出现误诊的情况。另外，建议患者在这期间，注意皮肤清洁，保持清淡饮食。
