牙齿里面的黑垢可能是牙齿的外源性着色，需要尽早通过洗牙去除，然后进行牙齿的抛光，洗牙之后尽量不要吃带颜色的东西，平时注意严格控制牙菌斑，不然可能会进一步发展形成牙周炎。
宝宝牙齿上有黑色软垢时，需要根据软垢的质地和牙齿的症状分别进行处理。
如果牙垢质地较软，能够刮动时，可能是附着在牙面的食物残渣，家长可以用指套牙刷蘸清水擦拭，一般能去除。如果黑色牙垢较薄，质地很光滑，可能为饮食中的色素沉积导致，一般可以不用处理。如果黑色区域是牙面上存在的缺损或龋洞，需要到医院就诊，及时进行修补和充填。
牙齿污垢可通过洁牙处理。牙齿污垢是由于喜欢进食容易着色食物，如槟榔、茶叶、烟草等，在牙齿表面形成的牙齿污渍。洁牙只能去除牙齿表面污垢，不能保证以后污垢不再附着，需尽量减少抽烟频率或喝茶浓度，方可维持效果。
牙齿有牙垢，首先需要好好刷牙，每次刷牙不得少于3分钟。每餐后加上睡觉前刷牙，至少要保证早餐后加上睡觉前刷牙。刷前要用牙线清理牙齿邻面牙颈部的食物残渣，然后再进行刷牙。刷牙的时候把牙刷放在牙龈和牙根的表面，在龈沟里进行水平震颤，然后再刷下咬合面，就可以把软垢清除。
牙齿上有黑点，如果是靠近牙龈的地方有黑点，认为是牙结石或牙菌斑的沉着，会进行超声波洗牙术，术后会对病人的牙齿进行进一步的喷砂、抛光，这样使牙齿不会更轻易的附着菌斑。