血液净化的并发症分急性并发症和慢性并发症。其急性并发症见于：低血压，可诱发心脑血管血栓的形成和血管內瘘的栓塞。透析失衡综合征，可出现恶心、呕吐、心律失常、抽搐、昏迷等，严重可危及生命。
危害有，过敏：部分患者在血液净化治疗过程中，会出现过敏情况，需要进行相应干预；破膜：早期透析器偶尔会出现破膜情况，可以替换透析器；出血：透析时本身要使用抗凝剂，抗凝剂可能会引起小量渗血或出血，一般出现几率较低，如果出现可改用无肝素透析或枸橼酸抗凝。
血液净化的危害应该是首次做透析时，会出现失衡综合征。中晚期时，会出现恶心、头疼、呕吐，甚至出现昏迷的症状；还会出现血管内凝血，血管凝血对病人有很大的危害。最后就会出现空气栓塞，就需要到规范的血液中心治疗。
血液净化替代了部分肾功能，具有清除水，排出毒素，调节酸碱平衡及代谢紊乱的作用，对急性中毒、药物中毒和毒物中毒的患者进行急救，一般采用血液灌流加血液透析法，对于肾衰竭的患者，其出现肾衰竭或高度水肿时，采用透析法，可减轻心力衰竭患者的心脏负荷，以及缓解其高度水肿的症状。
血液净化就是通常所说的透析，是指把血液引出身体外，并通过一种净化装置，除去其中某些致病物质，净化血液，达到治疗疾病的目的。血液净化包括血液透析、血液滤过、血液灌流、血浆置换、免疫吸附等。