头孢拉定是第一代头孢，头孢克肟是第三代头孢。头孢拉定对革兰阳性菌的杀菌作用强于第三代头孢；对各种倍他内酰胺酶的稳定性比头孢克肟差；对肾脏有一定毒性，与庆大霉素等氨基甙类抗生素或强效利尿剂合用时会加剧其毒性。而头孢克肟抗菌谱比头孢拉定广，抗菌活性更强；对倍他内酰胺酶稳定；对头孢拉定治疗无效的产生倍他内酰胺酶的细菌治疗有效；对绿脓杆菌等革兰阴性杆菌具有良好的抗菌作用；对肾脏基本无毒。
头孢克肟具有消炎的功效，主要用于敏感菌引起的毛囊炎、传染性脓疱疮、丹毒、皮下脓肿、乳腺炎、肛周脓肿等皮肤感染。头孢拉定具有杀菌的功效，可用于敏感菌引起来的呼吸道，泌尿道，肠道，软组织感染等。
头孢氨苄是第一代头孢菌素，主要作用于需氧的革兰氏菌如肺炎链球菌，头孢克肟是第三代头孢菌素，能够治疗对头孢克肟敏感的菌所致的轻度到中度的感染，如肺炎链球菌，淋球菌，大肠杆菌等。
头孢克肟是第三代头孢菌素，而头孢克洛是第二代头孢菌素。因此两者的抗菌谱有所不同。第二代头孢菌素对革兰氏阳性菌杀菌效果优于第三代。而第三代抗菌素对革兰氏阴性菌杀菌效果优于第二代。而且第三代抗菌谱更广，还对一些比如像铜绿假单胞菌有一定效果。有些肺炎，尿路感染，腹泻病人可以用头孢克肟。头孢克洛多用于上呼吸道感染。
头孢克肟分散片和头孢克洛分散片的差别是头孢克洛是二代头孢，肾毒性低于一代，对革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌均有效。头孢克肟是三代头孢，肾毒性低于二代，对革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌均有效。但对革兰氏阴性菌作用更强，对革兰阳性菌的作用比二代弱，三代对肝肾功能的影响比二代小些。
头孢克肟是属于第三代头孢菌素抗生素，临床上通常用于治疗淋病、扁桃腺炎和咽炎的治疗。头孢丙烯是属于第二代头孢菌素类抗生素，具广谱抗菌作用，临床上用于治疗急性上呼吸道感染，肺炎，支气管扩张，肺脓肿等疾病的治疗。区别就是第二代和第三代区别，还有抗菌能力强弱的问题。