手足口病后指甲可能会掉，需要根据病情来判断，具体分析如下：
手足口病是一种常见的传染病，主要发生于婴幼儿。一些儿童在手足口病康复过程中，会出现手部、脚部脱皮、指甲脱落等情况。孩子的指甲脱落主要是因为病毒侵入了指甲，导致甲母质功能暂时受到抑制，从而造成指甲生成障碍，也有一些家长认为是继发细菌感染造成。但是指甲脱落后的几天到一个半月就会重新长出新的指甲。在这段时间里，要注意对指甲的保护，保持局部的干净和防止感染。
手足口病是不会掉指甲的。手足口病主要是由肠道病毒感染引起的急性传染病，主要是口腔内出现疱疹或者是溃疡，多为舌、颊黏膜或者是硬腭处多见，手、足、臀部出现皮疹。
通常来说，得了手足口病不一定会掉指甲。
足口病是由肠道病毒引起的传染病，引发手足口病的肠道病毒有20多种（型），其中以柯萨奇病毒A16型（CoxA16）和肠道病毒71型（EV71）最为常见。多发生于5岁以下儿童，表现口痛、厌食、低热、手、足、口腔等部位出现小疱疹或小溃疡，多数患儿一周左右自愈，少数患儿可引起心肌炎、肺水肿、无菌性脑膜脑炎等并发症，但是得了手足口病不一定会掉指甲。
一般情况下，部分儿童在手足口病痊愈后半个月到一个月左右会出现指甲脱落的现象。
手足口病是由多种肠道病毒感染人体所导致的一种急性传染病，本病具有自限性，绝大多数感染者预后良好，一周左右即可自行痊愈，不会留有任何后遗症。手足口病可能是病毒侵犯神经末梢所导致指甲脱落的情况。一般来说，没有严重影响，建议给儿童适当补充钙剂，多晒太阳，多吃维生素B族含量丰富的食物，在一个月至两个月左右，就可长出新的指甲，不会留有任何后遗症。
在此期间，注意保护好手指，避免碰撞压伤。
孩子手足口病后，会出现指甲和手脚皮肤。这是手足病的并发症。家长不用担心，一般孩子的饮食习惯和睡眠是正常的，没有因指甲掉落引起的疼痛是正常的过程。这种指甲收缩并且变长，并且不会影响孩子。
儿童手足口病的发生通常伴有手部、口腔和臀部疱疹。反复发烧更有可能发生。这与病毒感染有很大关系。能做血常规检查等。如果有病毒感染，需要抗病毒治疗。发烧需要退烧药。平时不要饮酒和吃刺激性食物。在当地医生的指导下使用药物。