新生儿阻断乙肝失败原因是，乙肝病毒高水平复制的母亲尽管新生儿接种了乙肝疫苗和乙肝免疫球蛋白，失败的原因主要是宫内感染。宫内感染多发生于妊娠7个月以后，妊娠后期服用可以降低乙肝病毒高水平复制母亲所生新生儿的母婴阻断失败率。
对于乙肝女性来说，阻断失败的原因受多种因素的影响，有来自母体的因素，也有婴儿方面的因素。首先，母体病毒含量比较高，容易造成阻断的失败，尤其是乙肝病毒DNA水平的高低，越高，阻断失败的几率越高。
凡免疫失败者，其孕妇血清HBV-DNA含量大都在2.5pg/10μ以上。而孕妇乙肝传染性高，是导致乙肝疫苗免疫失败的主要原因。
HBsAg抗体阳性的孕妇是乙肝疫苗的免疫失效，因此，疫苗无法阻止HBV的母婴传染，其发病原因是HBV-DNA水平高的人群。
免疫失败的妇女，不管是单一的还是接种的，HBV-DNA的浓度一般在2.5pg/10μ以上。因此，妊娠期间的高感染率是造成接种不成功的重要因素。
新生儿乙肝是指新生儿期感染了乙型肝炎病毒。
新生儿乙肝是由乙型肝炎母亲通过母婴传播或围产期传播引起的。新生儿乙肝发病缓慢，临床上少见。婴儿乙肝阻断注射顺序：婴儿出生后12小时内应注射乙肝免疫球蛋白，同时注射不同部位的乙肝疫苗。乙肝疫苗接种的程序是0,1,6个月。该方案实施后的保护率为95%。接种完疫苗可以查乙肝表面抗原。
避免把乙肝病毒传染给宝宝最好的办法就是为新生儿接种乙肝疫苗，乙肝免疫球蛋白，单用乙型肝炎疫苗防止母婴传播保护率87.8%。如果采用联合用药方案可以有效地提高对新生儿的保护效果。对HBsAg阳性母新生儿而言，应于生后24h及早接种10μg酵母乙型肝炎疫苗，并在不同部位注射乙肝免疫球蛋白。
此外，孕妇有乙肝还应该合理饮食，避免油腻刺激的食物。
