细菌感染与病毒感染发烧的区别，首先致病菌不同，细菌感染是由细菌引起的，病毒感染是由病毒引起的。再有发病率有区别，普通感冒大部分是由病毒引起。症状不同，细菌感染症状比较重，退热后精神仍然不好，多为弛张热，病毒感染中毒症状轻，退热后精神好，多为稽留热，体温不容易降低。
细菌感染和病毒感染发热的热型并没有什么具体的区别，具体发热的症状也并没有什么区别的。但如果病毒感染程度不严重，是可以自愈的。细菌感染的情况下一般很难自愈，必须应用一些抗菌药物进行调理治疗的。
病毒性感冒发烧体温较高，而细菌性感冒发烧体温忽高忽低。病毒性感冒比较急，并且症状不稳定，而细菌性感冒开始症状较轻而2-3天后较重。但这些不是绝对的，要准确地说病毒性感冒和细菌性感冒有什么区别，就要看验血的结果。
有病毒感染者白细胞偏低或正常，早期中性粒细胞可稍高，细菌感染时白细胞和中性粒细胞均见高，病毒感染和细菌感染发烧，都可出现寒战高热。它们的区别，有3点：病毒感染可出现全身酸痛、乏力，而是细菌感染可出现咳嗽，咳脓痰。当使用抗生素以后，体温不降，是病毒感染，如果体温逐渐下降，说明治疗有效，是细菌感染。细菌感染的血象结果提示白细胞和中性粒细胞比例很高。
宝宝发烧，病毒和细菌的感染是有区别的。一般细菌感染引起的体温升高，医学称之为感染性发热，一般先有畏寒，持续15分钟到半个小时之后，体温会上升。病毒引起的体温升高，一般不会有寒颤。大多数宝宝的发烧都是由于病毒感染所引起，但是后期可能会合并有细菌感染，而两者感染的处理的方式是不一样的。
细菌感染会有高烧、寒战等症状，并且会有脓性分泌物出现，比如黄色脓鼻涕和黄痰等。而病毒感染多以低烧为主，没有脓性分泌物出现，主要以清鼻涕和白色泡沫痰为主。进行检查，如果细菌感染会出现白细胞和中性粒细胞升高，病毒感染白细胞和中性粒细胞在正常范围内或下降。