真菌性疾病与真菌感染有关，具有传染性，如果不治疗既有可能自身传染，也有可能传染给其他人。目前这种皮肤病主要采取抗真菌药物来治疗，积极的配合医生治疗效果还是比较好的，治疗的同时还需要注意局部卫生，局部干燥。
采用外用疗法治疗手指甲真菌感染，根据药剂的不同，分为浸泡，局部涂抹，封包削治。治疗时需配合去除病甲，故一般没有内服法方便，但却安全、无痛苦、无副作用。使用药的时候不要吃辛辣与刺激的食物。
指甲真菌感染可内服药物，单纯服用抗真菌药物，如灰黄霉素、氟康唑、斯皮仁诺等药物均有一定疗效，并且方便，但因为这类药物必须达到真菌所寄生的甲板处，才能发挥抗菌作用。患者应该尽早前往医院，在专业医生的指导下进行治疗。在生活当中也应当注意，不要过度的情绪激动，不要吃热性的食物，多吃蔬菜水果。平时少吃辛辣刺激的食物，忌烟酒，保持充足的睡眠，少熬夜。
脚气病主要是由真菌感染引起的一种常见皮肤病。根据脚气的不同类型，所需的药物也不同。病人应该接受对症治疗。例如，水泡型脚气应该用抗真菌治疗，但含酒精的脚气水和其他药物应该避免过敏反应。也可以溶液湿敷患处。
真菌性包皮龟头炎是导致阴茎真菌感染的主要原因。1.每天清洗两次包皮，可以使用温开水或复方黄柏液、红核妇洁洗液等中药洗剂。2.局部使用达克宁乳膏、贝雷松软膏等抗真菌药。每天清洁包皮空洞后，每天2次，均匀地涂在龟头和包皮内板上。3.在治疗过程中，尽量不要有性生活或者使用避孕套，性伙伴还应该进行霉菌性阴道炎的检查和治疗，避免反复的交叉感染。
一般来说，耳朵上真菌感染可以使用药物治疗。
外耳道真菌感染，外耳道会出现豆腐块般的白色分泌物，外耳道和耳廓也会出现红肿、潮湿的情况。可以将外耳道的分泌物用温水清洗，然后用抗菌药物滴在耳廓上，持续使用一个星期，直至所有的外耳道和耳廓症状都消失，并保持干燥。在治疗过程中要避免食用辛辣刺激的食物，辛辣刺激的食物和酒精会刺激外耳道和耳廓粘膜，导致病情反复发作。