厌氧菌感染人体后可引起多个部位感染，如呼吸道、肠道、泌尿系统、腹腔感染、胆道感染等，且多继发于基础病或免疫力低下者。本身无特异症状，症状主要为累及器官的症状，发生于中枢神经系统的感染可出现发热、头痛、颅内高压等，发生于呼吸系统的可出现咳嗽、胸闷、咳痰等，发生于肠道的可出现腹泻、腹痛等。
妇科阴道厌氧菌感染的症状，有一部分人是没有任何症状，有症状的女性主要表现为阴道分泌物增多，有腥臭味，有时会有外阴瘙痒或烧灼感。分泌物是灰白色，稀薄而不粘稠。确诊后要按疗程，规范治疗，细菌性阴道病容易复发，应及时看医生，对症治疗。
口腔厌氧菌感染，大多发生在牙龈炎或牙周病的病人身上，再就是牙结石的病人中也有可能存在，导致牙龈的肿痛。口腔的异味，要积极治疗，可以看一下口腔科，可以用抗厌氧菌的药物口服，控制感染，有牙结石可以需要先洗牙。
牙齿厌氧菌感染，发生在牙龈炎或牙周炎，再就是得牙结石的也有可能存在，导致牙龈的肿痛，口腔的异味，需要积极治疗，可以看一下口腔科，可以用抗厌氧菌的药物口服，控制感染，有牙结石可以需要先洗牙。
厌氧菌感染的症状是会引起白带量的增多，颜色淡黄，稀薄如水样，带有泡沫状，同时会有明显的鱼腥味表现。厌氧菌感染可以引起多种女性生殖道的感染，包括子宫内膜炎、子宫的积脓、子宫肌炎。
口腔厌氧菌感染的症状，有可能会伴随出现牙龈炎、牙周病、牙结石等一系列的口腔疾病，从而出现牙齿肿胀疼痛现象，及时去医院口腔科进行洗牙治疗，配合使用药物进行止痛处理。可能会由于厌氧菌感染从而引起局部组织坏死或者出现乳突炎、中耳炎或者局部形成脓液，情节严重需进行切除治疗。