病人的泌尿生殖系统感染了衣原体，这属于性传播疾病的一种，主要通过不洁性行为史感染。一旦患有这种疾病，短时间内不能再发生性生活，并且要进行积极有效的抗感染治疗。尽量是夫妻双方同时检查和治疗。
妇科衣原体可以通过药物治疗、生活护理等方式来治疗。
患者感染衣原体，可能会引发生殖器出现感染，患者可以在医生的指导下使用阿奇霉素、红霉素或四环素等药物进行治疗，平时还需要注意卫生，保持良好的卫生习惯。并且在治疗期间，避免发生性行为，以免出现交叉感染的情况。同时，伴侣也可以一同进行治疗。
霉菌性阴道炎是由念珠菌引起的一种常见多发的外阴阴道炎症性疾病。对单纯性外阴阴道念珠菌病选择局部用药为主，一般用药后2-3日症状减轻或消失。每天保证充足的睡眠，不要熬夜，注意把握好性生活频度。
女性衣原体感染的治疗主要有药物治疗、手术治疗等。
1.药物治疗：四环素，多西环素，红霉素，阿奇霉素，克拉霉素等一线治疗药物是肺炎衣原体感染的首选药物。四环素类、大环内酯类药物治疗沙眼衣原体感染。
2.手术治疗：沙眼后遗症和并发症的治疗，滤泡多的挤压术，睑内翻和倒睫者手术矫正。手术治疗合并尿道狭窄、女性不孕等。
患者应根据医生的判断，避免自行用药，选择适合自己病情的治疗方法，以免延误病情，防止病情恶化。遵照医生的指示进行治疗和用药。
肺炎衣原体阳性通常需要使用药物进行治疗。
肺炎衣原体阳性者提示机体内存在肺炎衣原体感染所致疾病，会导致气管炎、咽炎、扁桃体炎等疾病。肺炎的病情会使人体浑身发热、酸疼、声音沙哑等，咳嗽及其他症状。衣原体感染者可使用大环内酯类的药物，如红霉素肠溶片、罗红霉素分散片等进行抗感染治疗。