长期服用糖皮质激素会导致骨质疏松，因为糖皮质激素会影响体内钙的稳态，抑制小肠对钙和磷的吸收，增加肾脏对尿钙的排泄，导致继发性的甲状旁腺功能亢进和体内缺钙，抑制新骨骼合成，影响骨骼新生。
糖皮质类激素是体内一种重要的调节分子，糖皮质类激素对机体的生长、发育、代谢以及免疫功能具有重要的调节作用，是机体应激反应最重要的调节激素，也是临床上应用最广泛的抗炎和免疫抑制剂。
因病服用糖皮质激素需要注意尽可能的服用最小剂量，尽可能的缩短使用时间。某些疾病如自身免疫性疾病、特发性哮喘、某些慢性肾病等，在没有糖皮质激素的情况下是无法控制的，严重的会危及到患者的生命。但是长期使用糖皮质激素会导致骨质疏松。口服糖皮质激素的病人，在3至6个月内要进行骨密度、血钙、血磷、骨代谢等方面的检查，以便对骨质疏松进行诊断和治疗。
糖皮质激素是一种很强的非特异性消炎药，在急性痛风性关节炎初期使用，可减轻关节腔内渗出、水肿、充血、白细胞吞噬反应等，可迅速减轻关节的红肿热痛等症状，还可减少局部黏连和结缔组织形成，但不良反应大，故在痛风性急性关节炎发作，首先使用秋水仙碱或非甾体抗炎药。
糖皮质激素会发胖的，这类药物虽然非常有效，但是也会存在许多副作用，比如会造成脂肪组织的异常堆积。糖皮质激素在较大剂量下有很强大的抗炎作用，能保护机体不受炎症反应侵害，同时还能够抑制免疫反应，抗休克，因此用于治疗多种炎症，自身免疫病等疾病。
糖皮质激素副作用主要表现有向心性的肥胖，出现满月脸、水牛背、痤疮、多毛、高血钠和低血钾、高血压、水肿、高血糖，还有糖尿病加重、肾上腺皮质功能减退，甚至萎缩、闭经、肌肉消瘦、无力、骨质疏松、股骨头坏死和精神症状等。
