慢性肾盂肾炎的临床表现比较复杂，典型的慢性肾盂肾炎的临床表现并不常见，部分患者可能仅表现的是无症状性的细菌尿，大约半数以上的慢性肾盂肾炎患者都有急性肾盂肾炎发作史，随后会出现不同程度的低热、排尿次数增多、尿急、排尿不适，也会出现腰部的酸胀不适，随着病情的进展，慢性肾盂肾炎患者会出现夜间排尿次数增多，尿的比重降低。
首先是尿路感染的表现，尿路感染表现不是很明显，一般可以有乏力、低热和食欲下降等。也可以间歇性地出现腰痛，有时候会伴有尿频、尿急、尿痛等尿路感染的症状，也可以表现为间歇性的无症状性菌尿。其次是慢性间质性肾炎的表现，此时会出现肾脏浓缩功能下降，可以出现夜尿增多，尿的次数增多，容易发生口渴。
主要为尿频、尿急、尿痛、腰酸、腰痛、体温升高，是常见的尿路感染，主要由细菌引起。患者平时应保持私部的干燥清洁，要遵循医嘱用药，平时多喝水，每天要喝八杯水以上，多饮水可冲洗尿路，有利于炎症的恢复。
慢性肾盂肾炎临床表现为：乏力、间歇性低热、饮食不畅、腰部酸痛、季肋部或者腹部不适。同时腰部酸痛和肾小管功能受损，会出现如夜尿增多，低比重尿等。儿童表现为贫血、发育不良、生长迟缓或遗尿、尿失禁等。
慢性肾盂肾炎常见的症状就是腰疼，尿频、尿急、尿痛等尿道刺激症状，这种症状可以查一下尿常规检查看看有没有白细胞、脓细胞等，查一下泌尿系彩超检查看看有没有肾脏、肾盂等问题。
慢性肾盂肾炎通常都是急性泌尿系感染迁延不愈，反复发作所造成的。病人先有尿频，尿急，尿痛的症状，有人伴有发热，寒战这样的症状，治疗不及时，或者使用抗生素疗程不够，过早停药，造成肾盂内L型菌株的形成，病人反复发作。有的人由于泌尿系解剖结构异常，比如双肾盂，双输尿管，肾下垂等。