手术治疗，对于比较严重的肾积水致患侧肾功能全部丧失或有严重感染积脓，但对侧肾功能良好，可行患肾切除术；病因治疗，需要查明病因针对性治疗，原因可能是炎症感染，或结核杆菌感染，或者结石的原因造成的，也有可能是输尿管发育畸形。如果是炎症感染造成的，需要应用抗生素控制炎症。结石需要采取体外碎石，也可以采取药物溶石的方法治疗。如果发育畸形造成的需要采取手术治疗。
病因治疗，去除肾积水病因，保留肾患，手术方法取决于病因的性质，例如先天性肾盂输尿管连接部狭窄可作肾盂成形术，肾，输尿管结石可行碎石或取石术，这些手术近年可用内腔镜进行；手术治疗，对于比较严重的肾积水致患侧肾功能全部丧失或有严重感染积脓，但对侧肾功能良好，可行患肾切除术。
肾积水较轻，病情进展缓慢，肾功能已达平衡和稳定状态可观察，但应定期检查了解积水进展情况。可自行解除的梗阻，如孕妇生理性肾积水。肾积水进行性加重，临床症状明显，肾功能不断下降，梗阻病因明确，有并发症存在，应手术治疗。
出现肾积水之后，应到做穿刺治疗，这样可以帮助更好的治疗，引发肾积水的期间，更应该注意做好消炎措施，这个期间还应该注意保持饮食的清淡，而且应该注意做好滋补养生的工作，这样可以防止造成病情加重，也可以防止造成其他影响。
肾积水的危害，由于梗阻存在导致尿液排泄缓慢不畅，容易导致尿路感染的发生，会出现发热、腰痛、血尿以及尿频、尿急、尿痛等症状，化验尿常规可见尿中白细胞明显升高，化验血常规可有血中白细胞明显升高。