药物治疗，可口服或静脉输入抗真菌类的药物，来控制来消除症状；辅助治疗，如果是急性期的患者要多饮水，以增加尿量，对尿道有冲洗作用。有尿频、尿急及尿痛时，可服用解痉药物，并除去引起尿道炎的各种诱因。
对因治疗，尽可能去除各种诱发因素及积极治疗原发病，加强营养，增强机体抵抗力，补充大剂量维生素。中医治疗，中医常采用益气、补肾、清热利湿并重的原则，邪正兼顾，特别是对于湿热下注型患者疗效更为明显。
针灸疗法，适合脾肾两虚者，可选用脾俞、肾俞、足三里、中极、关元、命门等穴，用补法；辅助治疗，急性期应多饮水，以增加尿量，对尿道有冲洗作用。有尿频、尿急及尿痛时，可服用解痉药物，并除去引起尿道炎的各种诱因。
消除易感因素，如避免长期使用抗生素、免疫抑制药、解除尿路梗阻，控制糖尿病等使机体抵抗力下降的疾病，尽量减少导尿及长期保留尿管等。静脉滴注药液应避光缓慢地滴入，耐受性差者可酌减剂量;临床疗效差者可酌加剂量。
采用中医治疗，中医常采用益气，清热利湿并重的原则，邪正兼顾，特别是对于湿热下注型患者疗效更为明显。抗生素与化学药物联合应用，疗效较好，全身治疗应注意休息，补充足够液体。
艾灸治疗，适用于湿热下注者，可选取肾俞、膀胱俞、命门、三阴交、阴陵泉等穴，用泻法；药物治疗，可以用一些抗真菌类的药物，也可以局部冲洗，症状明显严重可考虑输液治疗，都具有比较好的效果。