以清淡为主，食用富含营养的物质，纠正偏食及不正常的饮食习惯，不宜食用刺激性、海产品等。巧克力囊肿手术之前应该做足术前准备，先提前冲洗阴道，然后积极消炎，防止术后感染，要空腹做手术，要在月经干净后3-7天后做手术，手术之前应该禁止性生活，保持心情良好。
空腹检查。但要注意自己平时的饮食习惯，在饮食方面没有什么特殊禁忌的，但平时需要均衡营养饮食，多吃新鲜蔬菜和高蛋白的食物。饮食尽量清淡，多吃些当季节的新鲜水果蔬菜和富含优质蛋白的食物，比如香蕉、火龙果、苹果、无花果、卷心菜、西红柿、鸡肉、鸭肉、鱼肉等。
巧克力囊肿属于子宫内膜卵巢异位症的一种，所以属于妇科的诊疗范畴。卵巢巧克力囊肿又称卵巢内膜异位囊肿，是子宫内膜异位到卵巢而导致的一种病症，主要与内分泌失衡有关。另外女性免疫能力低下，抵抗力很低，疏于身体锻炼，导致抗疾病的能力较弱，房事过频等，也都是导致女性卵巢巧克力囊肿的原因。
治疗巧克力囊肿不一定要切除卵巢，需要根据病人的具体情况来定。巧克力囊肿是女性患有子宫内膜异位症的一种病变，巧克力囊肿的发生主要是由于女性在月经期间出现子宫壁脱落出子宫内膜碎片引起引流不畅，导致经血不能完全从阴道排出，有少量的经血经过输卵管向盆腔倒流，从而发生血瘀，种植在卵巢表面或盆腔其他部位，形成异位囊肿。
巧克力囊肿住院治疗应是看看大小的，多数的手术需要住院，大于5cm需要积极手术。调养气血。手术需要保养，住院1-2周比较好的。注意调养生活的习惯，忌辛辣的食物，发性的食物应少吃比较好的，具体的看看恢复。看看妇科遵医嘱治疗。
要荤素搭配，饮食多样化。多吃新鲜的蔬菜和水果忌辛辣刺激性的食物。定期复查，做到有情况早发现。不使用蜂蜜及花粉等。平时加强体育锻炼，生活有规律。避免高度紧张及精神刺激，保持乐观情绪及充足睡眠。