空腹检查。但要注意自己平时的饮食习惯，在饮食方面没有什么特殊禁忌的，但平时需要均衡营养饮食，多吃新鲜蔬菜和高蛋白的食物。饮食尽量清淡，多吃些当季节的新鲜水果蔬菜和富含优质蛋白的食物，比如香蕉、火龙果、苹果、无花果、卷心菜、西红柿、鸡肉、鸭肉、鱼肉等。
巧克力囊肿属于子宫内膜卵巢异位症的一种，所以属于妇科的诊疗范畴。卵巢巧克力囊肿又称卵巢内膜异位囊肿，是子宫内膜异位到卵巢而导致的一种病症，主要与内分泌失衡有关。另外女性免疫能力低下，抵抗力很低，疏于身体锻炼，导致抗疾病的能力较弱，房事过频等，也都是导致女性卵巢巧克力囊肿的原因。
超过5厘米有扭转而导致肌肤症的风险，需要尽早的做手术治疗手术以后做病理检查。对于小于8厘米的巧克力囊肿可以进行药物治疗，使其缩小至完全消失。而对于较大的则以手术治疗为先，可以先使用药物治疗下。
囊肿的大小，症状，是否有生育要求来决定治疗方案。对于巧克力囊肿小于3cm的病人，可进行期待治疗。如果体积大于3cm的巧克力囊肿，合并不孕，可采取手术治疗，剔除囊肿。术后联合药物治疗预防复发，改善不孕。
B超发现卵巢囊肿，明确告知囊肿是良性还是恶性，是否诊断卵巢巧克力囊肿，这是不现实的。b超可判定盆腔是否有囊肿，囊肿位置及囊肿内部结构，但不能诊断子宫内膜异位症。子宫内膜异位症有时很难与卵巢恶性肿瘤、结核病和炎性肿块区分开来。
巧克力囊肿要手术治疗。巧克力囊肿地看看大小，如果巧克力囊肿特别大，并且症状很明显，短时间内未曾生育，必须马上手术，因为巧克力囊肿影响生育的。要是痛经不是很明显，短时间内没有生育要求，也可以用药物来治疗。巧克力囊肿最根本的治疗方法还是手术会更好一些。手术采用腹腔镜手术，效果很好。术后打针阻断内膜异位症的复发，阻断巧克力囊肿复发可以用一些药。所以，治疗巧克力囊肿的方法就是手术治疗。