通常不管是什么手术，操作都有一定的风险。
肛瘘手术过程分为挂线、瘘管切开、瘘管切除等。风险主要是术后会不会复发，伤口切开或挂线后，伤口愈合后是否会再次有肛瘘，这是简单的并发症，可能要进行处理，改变切开的方式，对于比较复杂、比较深的肛瘘，有时括约肌损伤后可能会导致排便功能差，严重的可能会导致大便失禁的情况。
南方医院，省妇幼保健院，六院等三甲医院。肛瘘的特点是反复不愈，外瘘口的皮肤常有假性愈合现象，有时肛瘘外口处的皮肤像个米粒大小的皮肤下陷或小疤痕；有时外表像一块小腐肉，但不久瘘口处出现红肿，接着破溃出脓。
肛瘘早期为肛周脓肿，其较表浅时，表现为疼痛、肿胀、发烧；较深部的脓肿，外表无表现，仅为肛管胀、不舒服及部分全身表现，易造成误诊。当脓肿用药后或自行溃破一段时间未愈合，会形成瘘管，引起肛瘘。
小儿肛瘘发病部位多在肛门两侧，瘘管多呈浅在、单纯、垂直。复杂而瘘深的较少。如果男孩或女孩发生肛瘘，其临床表现各有不同。男婴儿肛门发炎后红肿疼痛，形成脓肿后肛周皮肤肿胀光亮，中心软化，破溃后流出脓液而形成肛瘘，腹泻时大便从瘘管口流出。反复发炎脓肿破溃则成为慢性肛瘘。
小儿肛瘘与肛周脓肿有关系。
儿童的肛漏与肛周脓肿有密切的联系，一般都是肛周脓肿自己破裂后，或是肛周脓肿做了腹腔镜下的引流术后，就会出现肛瘘。肛周脓肿和肛瘘都是肛周炎症，分为直肠周围炎症的不同时期，即肛周脓肿为肛周炎症的急性期，肛瘘为肛周炎症的慢性期。
不论是肛周脓肿还是肛瘘，都应及时就医治疗，防止病情加重，影响身体健康。
孩子出现肛瘘，会出现疼痛以及排便次数的增多，包括出现肛门部位的红肿以及渗出液等。应及时带孩子去正规的三甲医院肛肠科进行检查和治疗，具体用药请遵医嘱。在治疗的期间，需要注意给孩子服用容易消化的食物。