卵巢子宫内膜异位囊肿破裂的原因有：经前或经期反复出血，使囊内压增加；妊娠期孕激素水平增高或使用外源性孕激素治疗时，孕激素使囊壁血管增生、充血水肿、组织软化而致破裂；排卵口的存在也可致囊肿破裂；因受外力挤压、性生活受压或妇科检查也可使囊肿破裂。
引起子宫内膜异位症的原因包括种植学说：月经期，经血从宫口、阴道排出体外是顺流而下，但是有小部分经血或因其他原因夹杂着脱落的子宫内膜碎片，由输卵管道流入腹腔，种植在盆腔脏器的表层形成子宫内膜异位病灶；免疫学说：与免疫系统缺陷有关；化生内膜；血行转移：出现在肺部的子宫内膜异位症，是通过血液循环将子宫内膜碎屑转移停留在肺脏上而发病。