大多数时候病人是感觉不到疼痛的，因为微创巧克力囊肿手术，大多数的时候都是用全身麻醉，手术过程中病人不会感受到疼痛，但是在手术结束后，病人会感受到伤口上的疼痛。在恢复期间，病人可以配合医院的药物，减少疼痛。
一般巧克力囊肿的病人是会出现腹痛的症状的，甚至是痛经进行性加重、性交疼痛、不孕及月经失调。这种病可以采用药物来对抗或抑制卵巢的周期性内分泌刺激。最初是用睾丸酮类的雄性激素，因副作用较大，而且效力亦不够强，已逐渐摒弃不用。后来则逐渐发展成为假孕疗法及假绝经疗法。
及时去正规的医院做进一步的检查，然后根据检查结果，尽快选择合理的方法手术治疗。如病情发现的比较早，治疗的比较及时，相信病情也是可以缓解的，在治疗过程当中，一定要把心情放松，思想上不要有什么压力。
巧克力囊肿会出现腹膜炎、不孕、急腹症、性交痛以及痛经的情况。巧克力囊肿的痛经一般是继发性的，逐渐加重。然而，少数没有明显的疼痛。主要原因是异位的子宫内膜受卵巢激素的影响，与正常子宫内膜发生相同的周期变化。月经后半期，异位子宫内膜增厚会造成充血，导致肿瘤内子宫内膜异位症的压力增大，因此月经时囊袋的血堆积，使囊壁应力在一定程度上增加并引起疼痛。
巧克力囊肿会引起腹痛的情况，建议平时注意饮食忌辛辣忌烟酒多吃水果，不要受凉，可以局部热敷，如果疼痛比较严重，一定要及时去医院检查。可以到医院做一个全面检查，必要的时候可以手术切除。
女性有巧克力囊肿最典型的症状就是痛经。观察一下囊肿的大小来决定治疗方案。如果巧克力囊肿比较大，并且位置并不是很好，那么还是尽早的手术治疗比较好一些。可发生剧烈腹痛、甚至休克，并伴恶心、呕吐。只要确诊，即立即手术切除。
