做卵巢囊肿手术一般需要半个月左右恢复，这个也算是小手术，现在通过宫腔镜做手术，恢复很快。手术伤口比较小，愈合的快，特别是体型，不胖的人恢复的更快。术后注意休息，不要过度劳累。
卵巢囊肿做手术需要2小时。卵巢囊肿尽管是常见的妇科疾病，但是由于囊肿性的生长有可能进一步恶化成肿瘤或癌症方面的病变，所以在得了卵巢囊肿之后，需要通过及时性的治疗和处理囊肿生长以及涉及到的组织后，才可以有效地将卵巢组织全面清理。
卵巢囊肿手术后一般可能需要6到8周左右时间就可以完全恢复了，由于卵巢囊肿的产生与雌激素分泌过多有一定的关系，所以日常生活中一定要注意科学饮食，形成良好的生活作息，防止精神压力过大，而尽可能的避免内分泌紊乱的发生。
卵巢囊肿分和病理性，生理性的可随生理周期的变化可以自然消失。由于疾病生成的病理性的囊肿，往往需要手术来明确诊断并作相应的处理。有囊肿时先要检查确定为生理还是病理性，再做处理。病理性的卵巢囊肿做微创手术，术后两周就可以恢复了，若是做开腹手术，需要休息一个月才可以恢复。
卵巢囊肿有良性、恶性、交界性之分。良性囊肿如滤泡囊肿大都在5厘米以下3厘米左右，此时应观察三个月，若两个月左右的时间内滤泡囊肿缩小或未增大，那么过一段时间后囊肿便会自行消失，但若囊肿继续增大(大于5厘米)就必须手术治疗了。
卵巢囊肿不好治疗，卵巢囊肿有良性、恶性、交界性之分，不是所有的囊肿都需要手术治疗。良性囊肿如滤泡囊肿大都在5厘米以下3厘米左右，此时应观察三个月，若两个月左右的时间内滤泡囊肿缩小或未增大，那么过一段时间后囊肿便会自行消失，无需手术。但若囊肿继续增大(大于5厘米)就必须手术治疗了。因此，发现后应进一步定期复检，明确是功能性还是肿瘤性的，以采取不同的治疗方法，不要盲目采取手术。