多囊性卵巢囊肿属于体内激素水平失衡引起的内分泌失调，严格来说不是疾病。及时进行手术切除就可以了，术后注意休息，避免食用油腻的食物，食用适量的蔬菜和水果，增加蛋白质的摄入量，多补充水分。保持良好的心情，能够有效的保护卵巢不受伤害。
卵巢囊肿的治疗方法主要是手术治疗。必要时需要配合化疗药物进行治疗。
如果卵巢囊肿为良性，有生殖需求，可以采取手术摘除，尽量保存正常的卵巢。若无生殖需求，则需将一侧或两侧的输卵管及卵巢摘除。卵巢囊肿为恶性肿瘤，应尽量将原发囊肿和转移灶进行切除，术后应在腹腔中放置导管，并通过腹腔内注入化疗药物来进行预防。
手术后，患者应该注意休息，不要过度劳累，以免撕裂伤口。
多囊卵巢囊肿可以手术治疗，如果囊肿比较小而且是良性的，一般不需要治疗也可以的，如果囊肿较大就可以手术，同时也要注意术后的保养，保持外阴清洁预防感染，少吃辛辣刺激性食物。
多囊卵巢综合征，首先就应该调整生活方式，应该控制饮食，增加运动，减轻体重。其次就是药物治疗了，可以周期性的口服短效避孕药，减少雄激素的产生，抑制子宫内膜的过度增生，抑制毛发生长，治疗痤疮，调节月经周期；对于有生育要求的女性，可以使用氯米芬等药物来诱发排卵。最后就是手术治疗。建议及时就诊，在医师指导下，选择治疗方案。
多囊卵巢囊肿可以是生理性的（即是正常的随生理周期的变化可以自然消失的）或病理性的（由于疾病而形成的囊肿），生理性的囊肿无需手术，而病理性的囊肿，往往需要手术来明确诊断并作相应的处理。
引起卵巢囊肿的原因主要以下几个因素：遗传因素，20%～25%有家族史；内分泌因素，临床上很多基本病理生理改变是卵巢产生过多雄激素，而雄激素的过量产生是由于体内多种内分泌系统功能异常协同作用的结果；此外还有生活方式因素以及环境因素。