巧克力囊肿术后可以吃药预防复发，吃药的副作用较小，不必打针。由于术后体质虚弱，要注意休息。还要调节情绪，调节免疫力，增强体抗力。月经期不要做剧烈运动。日常生活要注意保暖，避免受寒，要讲究个人卫生，多喝白开水，多吃新鲜蔬菜和水果，要按时到医疗机构进行复查。
做完巧克力囊肿的手术还是建议打针的，考虑为注射防止术后粘连及促排卵的药物的可能性大，对于有生育要求的，还是应该打针的。手术后要注意多休息及加强营养，有利于伤口及身体的恢复。
巧克力囊肿一般术后不会复发的，配合生活方面注意就可以了。平时一定要注意休息，饮食要清淡，多喝水，多吃青菜和水果，不要吃生冷辛辣的食物，注意腹部的保暖，定期做好复查，有情况要及时去医院处理。
巧克力囊肿是属于子宫内膜异位到卵巢引起的临床表现，子宫内膜异位症是指有活性的内膜细胞种植在子宫内膜以外的位置而形成的一种女性常见妇科疾病。临床常见症状为痛经，月经异常，不孕，性交疼痛等。术后药物治疗是规范月经周期，卵巢早衰与治疗无必然关联性。
这样的病症如果是通过手术治疗之后，又复发了，应该查找其复发的原因。可以去检查一下体内的激素水平，看看是不是有这类的原因引起的，如果与此有关，就要调理自己的内分泌状态。
卵巢囊肿比较大，并且发生破裂，手术之后还是要打针治疗的。巧克力囊肿是由于子宫内膜异位症造成的，打针是为了不让月经来潮，可以使手术后卵巢有时间好好修复，也可以预防卵巢巧克力囊肿复发。