巧克力囊肿20厘米是非常大的，对于巧克力囊肿的病患需尽快进行手术治疗，术后要服用一些药物进行抗炎治疗。如果确定是巧克力囊肿，不进行手术还会继续增大的，可以进行手术治疗，治疗后一个月正常转经后就可以进行备孕的。
巧克力囊肿是子宫内膜异位的一种，所以尽量多吃蔬菜水果，杂粮，有营养的食物，少吃海鲜，活血的营养品，经期不要吃寒凉食物，保持愉快的心情，充足的睡眠，还有要腹部保暖。
复发几率不大。巧克力囊肿术后人的对侧卵巢或同侧卵巢可能有新的病灶，医生又要开始重新用药，甚至有可能要面临再次手术。如果这种病人做过2-3次的手术以后，卵巢体积就会缩小，也就预示着卵巢功能会下降，将来有可能面临早绝经，或者卵巢的抗缪勒氏管激素会下降，卵巢的储备功能下降。
巧克力囊肿是子宫内膜异位引起的一种良性病变，是发生在卵巢上的隶属于子宫内膜异位症的一种。此病的特点是，手术复发率高。目前治疗相对比较好的是中医保守治疗。此病以继发性加重的痛经、不孕为主要表现特征。此病目前在妇科病症中的发病率占道了30%左右。
做，巧克力囊肿的初步诊断，主要是根据B超检查结果来判断。要结合临床病史综合性的分析，这种病人常常伴有痛经的情况，并且呈持续性加重的状态。巧克力囊肿大约有40%-50%的病人，在临床上会有不孕不育的病史。所以，除了做B超检查，还要结合病史综合性的分析。
巧囊是由于子宫内膜异位症引起的，子宫内膜异位症的多是有比较严重的痛经的，如果是由于出血引起的盆腔内有明显的粘连，可鞥会引起继发性不孕症的，所以说应该进行系统的治疗。