体外碎石的危害是可能导致永久性肾单位损失，并可导致一系列长期的不良反应，主要表现为肾实质损伤及包膜下血肿，肾盂破裂，肾单位永久性损失弥漫性纤维化瘢痕，完全性肾乳头坏死，甚至不可逆的急性肾功能衰竭。
主要就是肾脏的损伤。这一般都是因为结石体积比较大，直径超过两厘米、质地比较硬、多次碎石导致的；另外就是肾脏碎石后出血，这一般是因为反复多次碎石，两次碎石时间相隔太短，少于两周导致的；最严重的危害就是感染，这一般是因为结石本身已经导致梗阻，肾脏有感染，碎石导致细菌入血，引起败血症、脓毒血症问题，严重的有生命危险。
体外碎石对身体是有一定的影响的，即使是碎石以后，是需要喝一些中草药把体内的泥石，沙石彻底排出体外，防止碎石堆积再次形成结石。可以直接用石通草煮水喝帮助排石，不需要碎石。
肾结石在做体外碎石的时候，是有一些疼痛的，但疼痛是可以忍受的，因为毕竟碎石的时间不长，差不多就半个小时就可以了。碎石后应用抗炎药物防止感染，需要大量多喝水，多活动，饮食方面，不要吃菠菜，豆腐，或者是羊肉这些。
体外碎石一次费用在1千元-2千元左右，不同地区收费标准不一样的。体外碎石术经过多次释放能量而击碎体内的结石，使之随尿液排除体外。日常生活要经常多饮水，勤排尿，预防结石的诞生。
肾体外碎石的危害不大，这种体外碎石对身体肾脏并没有实质性的一个影响，但是这种结石要根据位置和大小的不同才能选择不同的治疗方式，要到泌尿外科或者是结石科室来检查彩超，这样才能做出一个明确的判断，根据结石的位置和大小不同来选择下一步的治疗方式。
