真菌性肠炎是由于真菌感染导致肠道内明显的充血、水肿、渗出，而表现为腹痛、腹胀、腹泻以及发热的一系列肠道的刺激性的症状。首先应该叮嘱病人禁食水，静脉补充液体，调整内环境的稳定，同时应该系统的抗真菌治疗。
小儿真菌性肠炎的症状如下：
儿童真菌性肠炎的主要表现是一天十到二十次的大便，粪便呈水样或豆腐渣状，有的儿童大便呈绿色，有的还会伴有腹胀、低热，有的甚至会呕吐。如果孩子得了霉菌性肠炎，可以在医生的指导下服用思密达、双歧杆菌等药物进行治疗。但是使用抗生素的话，不但会杀死肠道内的病菌，还会损伤到肠道内的有益菌，在服药两个小时之后，可以吃一些益生菌，这样可以起到保护肠道的作用。
考虑为中医所说脾胃不和消化不良而引起的这种临床表现。现在到专业的消化内科来检查便常规，这样才能做出一个明确的判断，根据不同的情况来选择敏感的抗菌药物治疗。后期来选择中医的健脾和胃。
一般情况下，肠炎结肠炎可以使用饮食调整以及口服药物的方式进行治疗。具体分析如下：
1.饮食调整：通常来讲，建议肠炎结肠炎患者可以适当吃葡萄、菠萝、橘子、菠菜等富含维生素的水果和蔬菜，加速炎症的消散，可以使症状得到缓解，少吃肉类食物。
2.口服药物：除饮食调整外，患者还可口服乳酸菌素片、多酶片等增加肠道有益菌的药物进行改善肠道功能。
直肠炎的治疗方法有以下几种：病因治疗，治疗原则应根据引发直肠炎的病因及疾病采取相应的治疗措施；对症治疗，直肠炎应采取灌肠，解除粪便压迫。直肠下坠疼痛者可给以痔疮膏。
