输尿管结石因导致尿液排出受阻，肾盂内压力突发增高，导致肾绞痛的发生。疼痛较剧烈，常常伴有恶心呕吐，及停止排气腹胀不适。需要与胆绞痛、阑尾炎、胰腺炎及卵巢囊肿蒂扭转等鉴别。肾绞痛可以通过肛门外用抗炎止痛药等。如果仍频繁出现肾绞痛，也可以通过行体外冲击波碎石，或留置输尿管支架解除梗阻，达到止痛效果。
临床症状有疼痛和血尿是输尿管结石的主要临床症状。可以出现突发性的腰腹部剧烈疼痛，呈阵发性的绞痛，疼痛非常难忍，可以放射到下腹部或者阴囊、阴唇、大腿内侧等。
当输尿管结石引起急性肾绞痛时，主要表现为患侧腹痛。疼痛的性质是绞痛、隐痛或钝痛，疼痛辐射到腰部、腹股沟、腹部、会阴等部位，出现血尿；多数情况下会伴有腹胀、恶心、呕吐等症状。临床上也有单纯的血尿症状。一些大结石通常不显示肾绞痛。体检是发现肾结石最常用的方法。
出现输尿管的水肿、感染、出血等。如果有不适症状出现后，术后需要抗炎、解痉止痛治疗，并且在术后1-2周左右需要复查彩超，了解结石的粉碎以及排石情况，避免碎石后结石嵌顿在输尿管，引起肾积水的情况出现。
可以吃一些具有清热解毒，利尿通淋作用的中药，对输尿管结石的治疗也是有一定帮助。输尿管结石单纯的使用中药治疗效果就不理想，这时候大部分病人需要进行手术治疗。