百日咳综合症的临床表现通常会先有流鼻涕、流眼泪、发热、轻度咳嗽等，然后慢慢的咳嗽会逐渐加剧，2个星期后会出现抽搐性的连续咳嗽，以夜晚居多，如果病历比较久，会引起声带水肿，并伴有鸡鸣样的尾音，也会有口嘴唇发青、呼吸困难等。通常情况下，一般是见于6个月内白百破疫苗还没有接种完全的婴儿，可以口服阿奇霉素、红霉素等大环内酯类的药物来治疗。
百日咳的常见症状是咳嗽，通常为痉挛性咳嗽和阵发性发作，咳痰少。剧烈咳嗽可能导致声音嘶哑或恶心呕吐。需要验血来确认诊断。不要吃辛辣的食物或生冷的食物。多喝白开水是有帮助的。
小孩百日咳的典型症状是阵发性、痉挛性咳嗽，咳嗽终末出现深长的鸡啼样吸气性吼声。一般发病比较缓慢，得病初期有低热和感冒的症状，咳嗽逐渐加重，以夜间为重，一周后出现阵发性一连串痉咳，并伴有吸气性吼声，反复发作，虽然咳嗽严重但是肺部多无异常体征。
第一期是卡他期，主要表现为类似感冒的症状，第二期为痉咳期，一般持续2-6周，咳嗽的特点是成串的、接连不断的痉挛性咳嗽后伴一次深长吸气，同时发出一种特殊的高音调鸡啼样吸气样吼声，第三期为恢复期。
百日咳综合征的症状有有以下几点：
1.咳嗽初期症状与普通感冒相似，但病程较长，治疗相对困难。
2.咳嗽进入痉挛期，孩子咳嗽得很厉害。咳嗽的时候满脸通红，屏住呼吸，会有乌鸦一样的声音。
3.百日咳综合征的症状时轻时重。如果感染了其他病毒和细菌，可能会反复发热。
百日咳综合征是一种与百日咳杆菌感染相似的临床症状，但不是由百日咳杆菌感染引起，可能与腺病毒感染有关。
百日咳主要是咳嗽呈阵发性已经痉挛性的咳嗽，咳嗽为唯一症状的，咳嗽时间较长。对于百日咳主要是百日咳杆菌感染而引起的呼吸道感染的症状的，可以采取抗感染治疗处理，减轻气道敏感性。
