单纯的血清碱性磷酸酶低于正常范围时，不结合其他检查结果不具有代表性，需要结合其他检查结果，共同进行诊断。另外，在重症慢性肾炎，甲状腺功能不全，严重贫血，营养不良，维生素缺乏，坏血病，呆小症等疾病中会出现碱性磷酸酶降低的现象。
碱性磷酸酶和谷氨酰转肽酶高偏高时说明肝脏有损，可以进一步去医院做超声或ct检查，如果服用其他的药物，也有可能会引起药物性肝损害，但是主要是以转氨酶升高为主。
儿童碱性磷酸酶偏高的原因的因素有很多，可以分为生理原因和病理原因。生理原因：正处于生长发育期的儿童，骨组织中的碱性磷酸酶很活跃，含量较多，会出现碱性磷酸酶偏高的情况。病理原因：骨骼疾病、严重性贫血、胆汁淤积性肝炎、梗阻性黄疸、原发性肝癌等都会造成碱性磷酸酶偏高的现象。
碱性磷酸酶含量偏高可能是肝功能有损伤，有生理性升高和病理性升高，生理性增高可能是过量进食高脂肪食物，病理性升高多见于佝偻病、软骨病、还有肝胆类病症如肝癌、肝炎肝硬化等。
肝功能碱性磷酸酶偏高，是以下几种病因导致的：可能是身体缺钙引起的，多吃钙含量高的食物，有牛奶、海带、紫菜、花生、油菜、豆腐等。存在慢性肝炎，与饮酒、感染就等因素有关，出现肝区疼痛的症状，可去医院做乙肝、丙肝检查，可能是肝功能出现问题。
小三阳碱性磷酸酶偏高，可以检查乙肝病毒DNA定量，如无异常，说明乙肝病毒并没有大量复制，酶学异常也不是乙肝病毒导致的，只需适当口服复方甘草酸苷，谷胱甘肽等保护肝治疗即可。
