气管镜的副作用，常见的是咳血，因为气管镜插入不当或操作粗暴、剧烈咳嗽等原因，而造成气管壁创伤性的出血所致。低氧血症，气管镜的操作过程中易发生刺激喉、气管的痉挛诱发呼吸困难，而表现为缺氧的状况。
气管镜检查需要八分钟到20分钟左右，气管镜检查是将比较细长的一根管子，从病人的嘴里或者鼻腔进入气管和支气管以及更远端，直接观察气管和支气管的病变，甚至可以根据病变进行相应的检查和现场治疗。
气管镜检查属于呼吸内科常用的检查方式，主要针对的是呼吸系统疾病，一般不会特别痛苦，有的患者可能反应强烈，会有恶心呕吐、咳嗽或者咽喉不适等症状。
气管镜检查需要到专业的医院进行，检查过程会更规范，动作也比较轻柔，而且现在气管镜都会进行局部麻醉，疼痛感也会减轻，如果痛感比较明显，可以进行全身麻醉，但是风险会相对比较大。
普通的检查，气管镜没有发现肺部有明显的病变，约5-10分钟即可完成支气管镜检查。如发现肺部有肿块，需要取活检，约10-20分钟可以完成，如肿块切除，一般0.5-1小时可以完成。如结核的冷冻治疗或者支架植入治疗，约1小时内可以完成。
肺癌分为周围型肺癌和中心型肺癌，如果是中心型的肺癌侵犯纵隔淋巴结，或者肿物已经侵犯到支气管内，或者支气管内原发的肺癌，这时做气管镜，可以在气管内看到肿物，可以行病理组织活检，从而送病理，确定肺癌的病理类型。周围型肺癌是在肺的边缘周边部分出现的占位，这时做气管镜检查是看不到肿物的，除非肿物已经多发转移，转移到支气管。
