一般来说，对于甲状腺功能亢进的药物，其不良反应主要有三种：
第一种情况，就是服用了药后会有皮疹，这属于一种过敏性的症状，一般会在全身和身体的不同地方都会有皮疹。
第二种是肝功异常，转氨酶增高是甲亢病人的主要症状，肝功异常、转氨酶增高等都很常见。
第三是由于服用了甲亢药物，导致白细胞减少，白细胞的总量减少后，嗜酸性粒细胞的绝对数值也会减少。
组织出血是抗凝药物主要的副作用。不同部位有不同的表现，但使用抗凝药物脑出血的发生率非常低，总体年发生率为0.5％。出血的发生与监测的INR及年龄的升高相关。服抗凝药物华法林一定要监测INR，及时、有效的监测是保证安全、减少出血的前提条件。
抗癫痫药物的副作用有胃肠道的不适，如恶心、呕吐，可出现头晕、头疼、嗜睡、视物双影、肢体活动的共济失调。抗癫药物的副作用还可以表现为血细胞的异常，如白细胞减少或血小板减少；还可以引起肝功能的损伤。
安眠药的副作用有：
一、是中枢神经系统的抑制。一般是安眠药的镇静作用引起的，患者会出现嗜睡、肌肉无力、身体协调困难等。
二、迷茫和迷失方向。这种情况多发生在老年人身上，可能会出现一定时期的暂时性失忆。但临床上并未证实服用安眠药与痴呆有直接关系。
三、其意的急躁作用。一些之前有攻击性行为或情绪不稳定的患者，服药后可能会变得暴怒或暴力，或出现幻觉，即欣快，可能会引起更严重的失眠。这可能是一种类似于服用安眠药后醉酒的失控现象。
四、抗胆碱作用。部分患者服药后会出现轻度视物模糊、口干等症状。
抗甲状腺药物治疗常见副作用有：
1、白细胞减少，严重患者可引起粒细胞缺乏。白细胞减少时，合并上升药物口服，定期复查血常规。发展为粒细胞缺乏，需停止抗甲状腺药物治疗，给予促进白细胞生成的药物。
2、肝功能损害、抗甲状腺药物可引起中毒性肝病，其中丙硫氧嘧啶最易导致丙转氨酶或谷丙转氨酶水平升高。给予抗甲状腺药物后，定期复查肝功能，必要时停用抗甲状腺药物，用保肝药物治疗。
3、出现皮疹后进行抗过敏药物治疗。皮疹严重时，可停止抗甲状腺药物治疗。患者口服抗甲状腺药物治疗出现严重不良反应，应考虑更换碘-131治疗或外科手术治疗。
