艾滋病生殖器疱疹可以用抗病毒药物进行医治，要合并病毒抑制类药物，连用2至3周或者一直到皮损治愈再停止。艾滋病合并生殖器疱疹的病患很容易出现复发几率高、排毒时间长、医治周期长。
生殖器疱疹病毒不像艾滋病毒一样。生殖器疱疹肯定是单纯疱疹病毒二型感染引起的典型表现，这个和艾滋病是没有任何相关性的。生殖器疱疹是病毒，艾滋病是人类免疫缺陷，病毒虽然都属于病毒，但是前者是单纯疱疹这种病毒，而二是病是属于人类免疫缺陷病毒，听名字就可以知道生殖器疱疹这种单纯疱疹就是一个单纯的疱疹，也就是水泡一样的改变，而艾滋病人类乳头瘤病毒，就是人类治病人类免疫缺陷病毒就是一个免疫缺陷综合症。
艾滋病和生殖器疱疹都属于一个性传播的疾病，但艾滋病和生殖器疱疹属于两个不同病毒感染引起的疾病，所以说是没有相互交错，不会引起联系。所以目前明确诊断以后需要积极的治疗才行，这两个疾病是不会相互演变的，有生殖器疱疹，不一定会导致艾滋病，同时治疗后还要注意复查。
生殖器疱疹和艾滋病有着密切的关系。生殖器疱疹病人中的艾滋病的感染危险性非常大，是普通人感染艾滋的5-10倍；生殖器疱疹的病原体的感染和发病为艾滋病病毒进入机体创造了合适的条件。生殖器疱疹产生的大量溃烂面积和看不到的微型皮损给艾滋带来了方面今日机体的机会。增加了机体对艾滋病的易感性，即使艾滋病阴性的人也更容易感染艾滋病。
生殖器疱疹和艾滋病是有绝对相区别，没有任何关联，需要知道生殖器疱疹是单纯疱疹病毒，二型为主要传播病源极少数的，单纯疱疹一型为病原体进行传播感染的疾病，艾滋病主要是通过艾滋病抗体进行检测筛查，属于人类免疫缺陷病毒，可以通过手术处理。
