患者会遭受一定程度的电磁辐射，电磁辐射对人体造成的危害，并不会马上表现出来，也是无法准确预测的。只能在日后观察，并不能预测患者会出现什么症状。虽然这些检查对于患者来讲，需要遭受电磁辐射，只有经过检查，才有可能明确诊断，才能够采取相应的治疗措施。做这些检查对于患者来讲，还是利大于弊的。
一般情况下，小孩做脑CT和核磁共振有一定伤害，但是伤害较小。
小孩做脑CT，通常有一定的辐射损小孩的全身影响是比较小的，因为一次脑CT受到的辐射量通常是有限的，只要不是多次进行，一般不会造成较大的伤害。而核磁共振对于孩子的伤害则相对更小，因为核磁共振的成像一般和射线没有较为明显的关系，因次，也不会对小孩造成较为明显的辐射性损伤。
怀孕期间可以进行核磁共振检查，因为孕妇有肥胖、羊水不足、胎儿已经进入盆内，或者是产前超声无法确认的情况。
可以为胎儿胃肠道和消化道的异常情况提供更多的补充资料。建议孕妇和家人不要害怕核磁共振会产生辐射，也不要担心会对胎儿的发育有什么影响。在怀孕的3个月内，胎儿正处在细胞的分化发育阶段，因此要避免做核磁共振。
核磁共振后可以立即怀孕。
目前并没有发现做核磁共振会对怀孕产生任何影响，所以在进行核磁共振后可以立即备孕。因为女性怀孕需要一段时间，并不是同房后立即就能怀孕，所以基本是不会受到核磁共振的影响的。女性如果有生育计划，最好提前半年进行备孕，补充身体怀孕所需的各种营养和维生素，比如叶酸。并养成良好的生活习惯，避免熬夜和劳累。
女性月经期间是可以做核磁共振的。
核磁共振没有放射性,检查前确定身上没有金属类物品,避免导致危险。经期做核磁共振提前跟医生沟通,若带有节育环不建议做核磁共振,因为节育环是金属类的。做核磁共振不会影响身体,部分患者会因封闭的空间导致幽闭空间恐惧综合症,感觉窒息、呼吸急促,这类症状极少见,女性经期做核磁共振没有多大影响。经期注意饮食,保持生活规律,女性经期身体虚弱,要多休息，饮食要清淡为主,不吃辛辣、刺激的食物,注意经期间护理，避免导致月经不调等情况。若是经期做检查,建议先跟医生沟通，了解注意事项,避免检查对患者带来不的影响。
