患者会遭受一定程度的电磁辐射，电磁辐射对人体造成的危害，并不会马上表现出来，也是无法准确预测的。只能在日后观察，并不能预测患者会出现什么症状。虽然这些检查对于患者来讲，需要遭受电磁辐射，只有经过检查，才有可能明确诊断，才能够采取相应的治疗措施。做这些检查对于患者来讲，还是利大于弊的。
一般情况下，小孩做脑CT和核磁共振有一定伤害，但是伤害较小。
小孩做脑CT，通常有一定的辐射损小孩的全身影响是比较小的，因为一次脑CT受到的辐射量通常是有限的，只要不是多次进行，一般不会造成较大的伤害。而核磁共振对于孩子的伤害则相对更小，因为核磁共振的成像一般和射线没有较为明显的关系，因次，也不会对小孩造成较为明显的辐射性损伤。
腰疼拍CT还是核磁共振，需要根据具体情况来定：
第一种是腰椎间盘突出、腰椎管狭窄、腰椎压缩性骨折等疾病，可以采用CT扫描来明确诊断。第二，腰椎核磁检查的主要适用于高位腰椎间盘突出，以及多节段的腰椎间盘突出，一般CT不能完全反映腰椎的突出情况。所以当腰椎突出范围很大的时候，最好做核磁共振检查。另外，腰椎血管瘤、原发性腰椎、继发恶性等疾病，需要进行MRI检查，以明确病变存在部位、骨质破坏的情况。
CT辐射最大，照多了可能对人体有致癌风险。X光片较小，一般对人体无影响。核磁共振最小，目前还未发现有明显辐射。X光为平面扫描，既从前后对人进行扫描，CT则为人的横断面扫描。核磁共振是一种三维成像技术，从前后，上下，左右三个方面对人进行扫描。
对身体有伤害的，如果长期或过量的接受CT的X线的辐射，就会使人体的基因受到损伤，导致各种有害的生物效应，其主要表现在致癌的效应及造血、生育、遗传、激素等方面的效应变化。
头疼拍ct比较好。头痛是日常生活中的常见症状，CT检查较实惠，较低费用即可解决部分较大的问题，如是否存在肿瘤或出血等，且大部分引起头痛的原因通过CT检查即可解决；若出现神经痛或颅脑神经压迫病变，MR检查效果更好，但MR收费相应较高。若患者出现头痛现象，医生将根据头痛不同的性质、部位、症状安排不同检查。若患者为持续、反复跳痛，且疼痛迁延不愈，则应进行磁共振检查观察神经的情况。引起头疼的原因是比较多的，建议根据头疼的原因进行选择，可以在医生指导下进行相关检查，确诊后治疗。
