肛周脓肿只能手术治疗，如果不及时治疗，有可能演变成肛瘘。肛周脓肿一旦治好，不再形成肛瘘。尽早手术的原因是肛门周围组织较疏松，且间隙多，故当一个间隙发生感染后常会迅速波及到其他间隙，引起多个间隙的混合感染，所以肛周脓肿应及早手术治疗。
治疗肛周脓肿的方法有手术，且越早越好。肛周及会阴部可见片状黑色病变，皮下可触及捻发音，严重的大片皮肤及筋膜进行性坏死，波及阴囊、大阴唇，有的到达直肠下段、下腹部、后腰部，面积广，蔓延速度快。
肛周脓肿应该进行手术治疗，这种病在日常生活中非常常见，常见于一些体形肥胖，长期久坐的人群，其中尤其以饮食辛辣刺激较多的人群为主。它的病因，主要就是因为感染，各种途径的感染，尤以肛窦感染扩散导致。
肛周脓肿化脓以后就会触及到波动感，需要进行手术及时的切开排脓，对于表浅的肛周脓肿，可以选择口服药物治疗，如果是范围比较大的脓肿，需要手术方式还要具体的病情来决定。
对于肛周脓肿，西医常用的是抗生素，可以通过口服或者静脉点滴来进行治疗。
对于肛周脓肿，可以在浅浅的地方涂抹，如果是在皮肤比较浅的地方，那么就可以进行手术。反之，局部脓肿不是消失，而是扩大，或者是软化，就是已经形成了脓液，可以通过切口排脓。对于小儿肛周脓肿，父母要立即送到正规的医疗机构进行正确的处理，以促进病情的好转。上述药品需要在医生的指导下服用。
