外科治疗，如损伤轻，伤口小，无污染时，只需行单纯清创缝合，如损伤重，位置深应行结肠造口，伤口愈合后应定期扩张肛门和直肠，预防狭窄。外敷药物，采用中西药物配制消炎止痛软膏，直接涂于裂口处，能减轻疼痛和缓解括约肌痉挛。
脓肿形成之前或早期，可采用抗感染治疗。脓肿形成时，即应手术引流。脓肿大且全身症状重者，除根据临床和药敏试验选择有效抗生素外，尚需辅以支持对症治疗。在脓肿切开引流时，若发现明确的内口，可同时行挂线术。
抗生素治疗，脓肿大且全身症状重者，除根据临床和药敏试验选择有效抗生素外，尚需辅以支持对症治疗。外敷药物，采用中西药物配制消炎止痛软膏，直接涂于裂口处，能减轻疼痛和缓解括约肌痉挛。
近端造口术：目的是为了防止肛门、肛管修复后局部感染，作乙状结肠造口术。抗感染治疗，包括针对需氧菌及厌氧菌的抗生素、中药清热解毒、疏泻通宣，通便、热水坐浴、理疗等。
可采用以下医治办法。抗感染治疗：造口远端乙状结肠和直肠应用生理盐水充分灌洗，并运用抗生素清洗，以防感染。抗生素治疗：脓肿大且全身症状重者，根据临床和药敏试验选择有效抗生素治疗，且需辅以支持对症治疗。
治疗采用以下办法更好。局部清创术：轻度肛管损伤，如肛管壁擦伤、轻度裂伤且污染较轻时，可局部行清创术。挂线术治疗：在脓肿切开引流时，若发现明确的内口，可行挂线术进行治疗。